... help . ... files . ... _cores/pair_cores.py Tue Jul 12 23:57:18 2011 +0400 1.3 @@ -8,88 +8,86 @@ 1.4 from copy import copy 1.5 1.6 from protein_pdb import Alignment , Block, Monomer, Sequence 1.7 -from allpy import processors 1.8 +from allpy import processors, markups 1.9 import allpy .base 1.10 from html import html_template 1.11 +from allpy .structure import CachedDownloadPdb, cached_download_pdb 1.12 1.13 -def remove_monomers_without_structure(block): 1.14 - monomers ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>112900) - kodomo.fbb.msu.ru/ )

• allpy: df571a5233fb
• allpy: 757f2a1f8732
• allpy: f8bd7c469fcf

Scoring Matrices . Matrix Sequences Sequence Consisting of the first four Amino Acids in the Protein GYRB_ECOL: . ... Sequence Achieved by Substitution of the 2nd and 4th Amino Acid and Insertion between the 3d and 4th Amino Acid, in the Protein GYRB_ECOLI, to randomly chosen new amino acids: . ... Matrix Sequences Sequence Consisting of the First Nine Amino Acids of the Protein GYRB_ECOLI: . ... Sequence Consisting of 2nd, 3d, 7th, 8th and 9th Amino Acid Residues of the Protein GYRB_ECOLI: . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>5756) - kodomo.cmm.msu.ru/ )

• Множественное выравнивание.
• alignment

SVETKA, a program for Analysis of Multiple Sequence Alignments . ... Analyse your alignment . ... Alignment . Nota Bene! .aln or .fasta format required!! Look here for comments . ... Nota Bene! Special scheme format required! ... Development of the program is supported by Ministry of Education and Science of the Russian Federation (State Contract No. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>6987) - mouse.belozersky.msu.ru/ )

• Geometrical core
• S : rm_systems
• Example of alignment

. SVETKA, a program for Analysis of Multiple Sequence Alignments . Helps (useful info) . Analyse your alignment . Interesting . links . Our Country . loads for a long time! . Our City . Our University . Our Institute . Our seminar . Our project . Name (optional) . Alignment . Nota Bene! .aln or .fasta format required!!! . Look here for comments . Tree (optional) . Nota Bene! Special scheme format required! . Look here for comments .

Еще в разделе: (Показать все результаты (>1334) - monkey.belozersky.msu.ru/ )

• SVETKA, a program for multiple sequence alignments analysis
• ETS sequence conservation
• SDP home page

... 2011/12/09 . ... added alignment merging . added parameter corresponding to the width of output alignment . fixed homologue searching for very long query sequences . ... Copyright 2010-2011 Yury Pekov ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>32) - mouse.genebee.msu.ru/ )

• ConClus
• Nhunt

Электронная библиотека Попечительского совета . ... Althaus E. - A branch-and-cut algorithm for multiple sequence alignment . ... Название: A branch-and-cut algorithm for multiple sequence alignment . Автор: Althaus E. Язык: . ... Электронная библиотека попечительского совета мехмата МГУ , 2004-2016 . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>2963) - lib.mexmat.ru/ )

• Lathrop R.H., Rogers Jr R.G., Smith T.F. - A Bayes-optimal sequence-structure
• Korf I., Yandell M., Bedell J. - Blast (Basic Local Alignment Search Tool) ::
• Brown S.M. - Bioinformatics: A Biologist's Guide to Biocomputing and the

Application of evolutionary model in the evaluation of the quality of pair wise alignment of amino acid sequences Valery Polyanovsky, V. G. Tumanyan Engelhardt Institute of Molecular Biology, Russian Academy of Sciences, Moscow, 119991 Russia ... : polyanovskyvo@mailfrom.ru, tuman@eimb.ru The purpose of the work is to develop a universal method for estimating the pairwise alignment quality depending on the evolutionary distance (degree of homology) between the ... REFERENCES 1. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>235) - mccmb.belozersky.msu.ru/ )

• http://mccmb.belozersky.msu.ru/2015/proceedings/abstracts/161.pdf
• http://mccmb.belozersky.msu.ru/2013/abstracts/abstracts/215.pdf
• http://mccmb.belozersky.msu.ru/2015/proceedings/abstracts/4.pdf

Given word length and max number of mismatches . Use MEME algorithm for define conserved blocks . Apply the Dynamic programming algorithm to create chain of the blocks . Refine the chain using combined profile for chain of blocks. ... Reduce word length and number of mismatches and repeat the procedure for spacer between the blocks. ... Create helix profile and apply MEME-like iterative procedure to find sets of helices that consistent lokated reative to conserved blocks . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>144) - bioinf.fbb.msu.ru/ )

• Input Formats
• SDPpred
• SDPsite - Algorithm Format requirements

AliGraf - GeneBee Graphical Alignment Help Type in a title for this session for you to remember. ... Type in an alignment algorith name (Genebee, ClustalW, Manual.. ... Even - all column space are colored; Sparse - every column is colored with respect to the column weight: less weight more space is left uncolored; Very sparse - more space is left uncolored. ... Also you can get a picture when only selected groups are colored. ... Group set depends on selected group type. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>165) - www.genebee.msu.ru/ )

• AliComp - GeneBee Alignment Comparison Help
• Multiple alignment
• Bioinformatics portal, Moscow State University

Evalign . Evalign is a computerised evaluation method for protein sequence alignment algorithm. It compares computer alignments with structural alignments of protein sequences and tells how correct your sequence alignment program is. It gives additional information on the characteristics of different alignment algorithms and shows types specific failings in alignment. ... None . ... SAL Home | Other Scientific Fields | Chemistry, Biology Related . ... SAL@KachinaTech.COM . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>595) - www.sai.msu.su/ )

• SAL- Other Scientific Fields - Chemistry, Biology Related - DCSE
• SAL- Other Scientific Fields - Chemistry, Biology Related - ClustalW
• SAL- Other Scientific Fields - Chemistry, Biology Related - HMMER

Изучение статистики наиболее длинной общей подпослеовательности двух случайных подпоследовательностей является одной из самых интересных и трудных задач вычислительной математической биологии. В докладе будут представлены результаты, касающиеся статистического распределения общих подпоследовательностей в упрощенном (некоррелированном) варианте модели, т.наз. модели Бернулли . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>60) - polly.phys.msu.ru/ )

... Derived datatypes . Up: Point-to-Point Communication Next: Datatype constructors Previous: Null processes . ... Instead, MPI provides mechanisms to specify more general, mixed, and noncontiguous communication buffers. ... More general communication buffers are specified by replacing the basic datatypes that have been used so far with derived datatypes that are constructed from basic datatypes using the constructors described in this section. ... A sequence of basic datatypes . ... Центры . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>255) - www.parallel.ru/ )

... Another way to fend off and detect impostors is to use call sequence checks. Call sequence checks help you protect against intruders that somehow managed to find out the password you log into your UUCP system with. ... When the attacker call your UUCP feed and steals your mail, this will increase the feeds call sequence number by one. ... If you have enabled call sequence checks, you should check your log files regularly for error messages that hint at possible attacks. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>97) - itpm.msu.su/ )

. Выберите категорию обращения: Общие вопросы Отчеты Рейтинги Диссертационные советы Конкурсы Ввод данных Структура организаций Пользователи Проблемы с регистрацией\входом в систему . Тема обращения: . Описание проблемы: . Введите почтовый адрес: . Войти в систему . Регистрация . Главная . Поиск . Статистика . О проекте . Помощь . Издательство: Taylor & Francis . Местоположение издательства: United Kingdom . ї 2011-2015 НИИ механики МГУ . Лаборатория 404. Все права защищены. обратная связь . Создать

Еще в разделе: (Показать все результаты (>433) - istina.msu.ru/ )

• Journal of Integer Sequences - журнал | ИСТИНА - Интеллектуальная Система
• Protein sequences & data analysis - журнал | ИСТИНА - Интеллектуальная Система
• METHOD FOR SIMULTANEOUSLY DETECTING A PLURALITY OF RNA SEQUENCES IN A

Distributed under the terms of the GNU General Public License v2 # $Id$ EAPI=5 inherit eutils flag-o-matic multilib toolchain-funcs EXTENSIONS = -without- extensions DESCRIPTION= Multiple sequence alignments using a variety of algorithms HOMEPAGE= http:// mafft .cbrc.jp/alignment/software/index.html SRC_URI= http:// mafft .cbrc.jp/alignment/software/${P}${ ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>9040) - mirror.msu.net/ )

• http://mirror.msu.net/pub/gentoo-portage/sci-biology/mafft/mafft-7.215.ebuild
• http://mirror.msu.net/pub/gentoo-portage/sci-biology/t-coffee/t-coffee-9.03.1318-r1.ebuild
• http://mirror.msu.net/pub/gentoo-portage/sci-biology/bwa/bwa-0.7.12.ebuild

Next: Roche lobe overflow (stage Up: Principal Evolutionary States of Previous: Main-sequence stars (stage I) . ... The duration of this stage for a binary component is no longer a function of the stellar mass alone (as in the case of single stars), but also depends on the initial binary type (A, B or C) (Iben and Tutukov, 1985, 1987[ 74 , 75 ]): . The radius of the post-MS star rapidly increases (on a thermal time-scale)   and reaches characteristic giant values. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>85) - xray.sai.msu.ru/ )

• Main-sequence stars (stage I)

Astronomy Picture of the Day . La Palma Eclipse Sequence . ... Credit Copyright: Miguel Claro ( TWAN ) Explanation: At left, a dramatic image sequence follows late September's total lunar eclipse above a rugged landscape and sea of clouds from the Canary island of La Palma . Composited in a circular fisheye projection, the brightness of the Full Perigee Moon changes drastically in transition from outside the total eclipse phase compared to its dim glow during the 72 minute long totality . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>3759) - www.astronet.ru/ )

• Alaska Aurora Sequence
• Bakasa Eclipse Sequence
• A Mercury Transit Sequence

. [ Войти ] . Главная -> Фильмы -> The Lost Spider Pit Sequence . Пользователи . Демо . Деньги . Фильмы . Форум . The Lost Spider Pit Sequence . Новая Зеландия 2005 . отметить . Фантастика . Ужасы . Триллер .

Еще в разделе: (Показать все результаты (>6) - kinfo.ru/ )

... Пользователи -General- Common Current University Society Study Diaspora FAQ Real Estate -Technical- Development Hard&Soft Network Mobile -Market- Market Services Job -Hobby- Behemoth Health Love&Sex Еда Media Games Auto&Moto Sport Hobby Flood Zone -Servant- Alternative Forums Forum -Garbage- Revolution Garbage Private . ... clesed] ORACLE:>> ALTER SEQUENCE ? ... Re: ORACLE:>> ALTER SEQUENCE ? ... alter sequence seq increment by m-n . ... alter sequence seq increment by oldvalue . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>193) - www.snto-msu.net/ )

• MIDI Sequencer - Help, plz - Public forum of MSU united student networks

... Главная последовательность (ГП) - наиболее населенная область на диаграмме Гецшпрунга - Рессела (ГР). ... Основное время жизни звезда проводит на главной последовательности и поэтому главная последовательность - наиболее населенная группа на диаграмме ГР (до 90% всех звезд лежат на ней). ... Для звезд главной последовательности существует апроксимационное соотношение, известное как зависимость масса-светимость. ... Звезды проводят большую часть своей жизни на главной последовательности. ... 33,000 ....

Еще в разделе: (Показать все результаты (>556) - crydee.sai.msu.ru/ )

• Standard Schoolhouse Rock Introduction Sequence