... Расстояния между листьями остаются теми же, что были во входной матрице, а ... расстояний в новой матрице будет расстоянием между двумя листьями, отличными от A и ...
... Реконструкция и сравнение деревьев. Расстояния между последовательностями. Построение дерева . Отобранные бактерии . Скобочная формула дерева . ...
... быть 3 матрицы попарных расстояний: "истинных", неоткорректированных расстояний или несовпадений (D) и расстояний по Джуксу ... По полученным данным постройте график зависимости 2-х оценок расстояния (D, JC) от величины "истинного" расстояния (T). ...
... расстояния между нуклеотидными последовательностями : 1) простейшего способа оценки ... эволюционных расстояний, определенных разными способами, от "истинных" расстояний ... график зависимости 2-х оценок расстояния от величины "истинного" расстояния ...
... минимум 3 матрицы попарных расстояний: "истинных", неоткорректированных расстояний или несовпадений (D) и расстояний по Джуксу ... По полученным данным постройте график зависимости 2-х оценок расстояния (D, JC) от величины "истинного" расстояния (T). ...
... матрицу "наивных" эволюционных расстояний между последовательностями Вашего ... Договоримся считать эволюционным расстоянием (D) величину D = 100 - P , где P ... Рядом создайте матрицу попарных эволюционных расстояний (формулы должны быть видны!) ...
... расстояния в моей модели: число точечных замен на 100 нуклеотидов») Приведите ... расстояний» По полученным данным постройте а) точечную диаграмму, по оси X ... расстояний в данные для построения графика, т.е. в таблицу вида имя пары - расстояние ...
[
Текст
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/year_03/doc/term3/Practice12.doc -- 52.0 Кб -- 30.11.2004 Похожие документы
... Реконструкция филогенетического дерева . Оценка эволюционных расстояний . ... Оценка эволюционных расстояний при помощи программы fneighbor. ... программы frpotdist оценивалось эволюционное расстояние между последовательностями ...
... m ( A ) ? m ( B ), где d ? расстояние из матрицы, а m ? среднее расстояние до всех остальных последовательностей. ... расстояние из матрицы, а m ? среднее расстояние до всех остальных последовательностей. Объединяем пару в кластер.. ...