Цель данного занятия ознакомится с возможностями гомологичного моделирования комплекса белка с лигандом. ... Используя известную структуру лизоцима форели ( 1LMP ) как образец, надо построить модель комплекса лизоцима гориллы (LYSC_GORGO) с лигандом. ... Построим выранвивание последовательностей лизоцима форели и лизоцима гориллы с помощью программы ClustalW . ... После имени последовательности моделируемого белка добавьте строчку: . ... Модель 1 . ... Anomalous bond lengths . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>2213) - kodomo.cmm.msu.ru/ )

• Гомологичное моделирование комплекса белка с лигандом.
• Гомологичное моделирование комплекса белка с лигандом
• моделирование.занятие1

... Коробейников С.Н., Ревердатто В.В., Полянский О.П., Свердлова В.Г., Бабичев А.В. Нелинейные уравнения механики деформируемого твердого тела применяются для математического моделирования тектонических процессов. ... Проводится исследование степени важности учета геометрической нелинейности уравнений механики деформируемого твердого тела при решении типичных задач моделирования тектонических процессов. Решается задача о надвиге деформируемой плиты на абсолютно жесткое тело. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>297) - num-meth.srcc.msu.ru/ )

Развивается приближение гибридного метода квантовой и молекулярной механики (КМ/ММ), основанное на потенциалах эффективных фрагментов (ПЭФ) (M. Gordon и соавторы), для моделирования свойств и реакционной способности больших молекулярных систем. ... Целью моделирования является разгадка механизма возгорания. ... Мы разрабатываем новую компьютерную программу молекулярной динамики для твердых тел, которую планируем использовать в будущем для комбинированной квантово-классической молекулярной динамики. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>12) - lcc.chem.msu.ru/ )

... РАН Вл.В.Воеводин ( voevodin на parallel.ru ) Почтовая рассылка о новостях сервера. Выпуск 268 . 7 июля 2009 г. ------------- Компания Intel совместно с Российской корпорацией нанотехнологий ( Роснано ) при поддержке суперкомпьютерной программы СКИФ ... объявляют о старте второго ежегодного конкурса по применению высокопроизводительных вычислений Максимальная масштабируемость - 2009 . http ://ru. intel .com/business/community/?act=abouthpc2009 ------------- ЧТО НОВОГО? http :// ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>427) - mail.parallel.ru/ )

• PARALLEL.RU - Новости, выпуск #329 [10/07/2012]
• PARALLEL.RU - Новости, выпуск #387 [17/06/2015]
• PARALLEL.RU - Новости, выпуск #389 [21/07/2015]

А.В.Шанин . Существует значительное число коммерческих программ для расчета акустических свойств помещений. ... Однако имеются основания думать, что вычисления можно организовать как-то по-другому, например, используя собственные моды помещения. Эти собственные моды могут иметь достаточно сложный вид (см. рисунок) и сильно отличаться от собственных мод простых объемов, изучаемых в курсе ММФ. ... Несколько первых собственных мод прямоугольного двумерного "помещения" с окном ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>68) - acoustics.phys.msu.ru/ )

... Написать комментарий . ... Моделирование прохождения Меркурия по диску Солнца . ... Пояснение: Сегодня, 8 ноября, в 19 часов 12 минут по всемирному времени Меркурий в течение пяти часов будет ползти по по диску Солнца . ... Соотношение видимых площадей Меркурия и Солнца равно 1:200. ... Это будет второе прохождение Меркурия по диску Солнца из 14-ти в 21-м столетии. Следующее похожее явление произойдет в июне 2012 года, это будет прохождение Венеры по диску Солнца. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>8146) - www.nature.web.ru/ )

• Интернет-конференция "Компьютерное и математическое моделирование в
• Моделирование черных дыр на суперкомпьютере
• Н.Бейли. Математика в биологии и медицине

... Гомологичное моделирование комплекса белка с лигандом . Построим выравнивание последовательности из структуры ID: 1lmp и белка 2IHL (LYSC_COTJA). ... P1;1lmp После имени последовательности моделируемого белка добавлена строчка: sequence:ХХХХХ::::::: 0.00: 0.00 эта строчка описывает входные параметры последовательности для modeller. ... имя файла с выравниванием и имена последовательностей образца и моделируемого белка, строчка 13 (а имя файла со структурой содержится в выравнивании) . ... 0.018 . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>262) - kodomo.fbb.msu.ru/ )

• Block_1_all_tasks/term3/2008
• Task 9, term 6
• Task 1, term 6

Моделирование пожаров и информационная технология. ... 2001. ... Моделирование использовалось для оценки альтернатив противопожарной обработки, прогноза возможных изменений экосистем и оценки риска для жизни и имущества вследствие пожаров. Модели использовались также для разработки пожарных предписаний, руководств и управления пожарными операциями и прогноза развития пожаров. Приводится терминология, связанная с моделированием пожаров и горимости. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>526) - ecoinformatica.srcc.msu.ru/ )

• http://ecoinformatica.srcc.msu.ru/print_html.php?keyword=&num_records=1&theme=5&subtheme=19&from=&ref_ind=0501002374
• http://ecoinformatica.srcc.msu.ru/print_html.php?keyword=&num_records=1&theme=5&subtheme=26&from=&ref_ind=0410001542

... Организация программ анализа данных GRAAL представлена на рис.9.1. Наряду с программами для обработки и анализа экспериментальных данных, существует набор программ для моделирования эксперимента. ... Программы анализа данных написаны на языке FORTRAN77, с использованием библиотек GERNlib 2. ... Программы PAW (Physics Analysis Workstation) и ROOT - это интерактивные программы анализа данных и графического представления результатов, с возможностью автоматизации посредством скриптов. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>427) - nuclphys.sinp.msu.ru/ )

• Шалфей

системы автоматизации, автоматизированные системы , информационные системы , мобильные и встраиваемые системы , программное обеспечение, вычислительные системы , средства связи,базы данных, информационные технологии,технологии программирования, обработка изображения, параллельные вычисления, информационное моделирование,математическое моделирование, вычислительный эксперимент, информатика,методы вычислений, численный анализ, numerical ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>334) - srcc.msu.ru/ )

• Чечин Д.Г., И.А.Репина, В.М.Степаненко. Численное моделирование влияния
• Мортиков Е.В. Применение графических процессоров для численного моделирования
• Лаборатория математического моделирования

О кафедре . История кафедры . ... Наглядная и компью терная геометрия и топология . Задачи для исследования . ЗАДАЧИ ПО ПРАКТИКУМУ . ... решений некоторых задач по Практикуму. Программы отбирали аспиранты кафедры: П.Андреянов, А.Воронцов, М.Гортинский, К.Душин, М.Жданова, А.Короткевич, Т.Лепский, А.Москвин, Д.Новиков, Д.Синицын. Ролики подготовлены сотрудниками кафедры. ... Задача 1. AVI EXE . ... Посмотреть курсовые и дипломные работы студентов кафедры >> ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>116) - dfgm.math.msu.su/ )

... Это было совершенно неожиданно для всех, кроме английского ученого-кораблестроителя В. Рида, который предварительно провел исследования на модели броненосца и установил, что корабль опрокинется даже при небольшом волнении. ... Модели и моделирование используются человечеством давно. ... Хорошо построенная модель, как правило, доступнее для исследования, нежели реальный объект. ... Процесс построения модели называется моделированием. ... Объект Модель Изучение модели Знания об объекте . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>1219) - uneex.lorien.cs.msu.su/ )

• 10.2. Xv
• Ассоциация файлов
• Матрицы

Задание 1: моделирование структуры белка по гомологии. ... Модификация файла со структурой: удалите всю воду из структуры (в текстовом редакторе) всем атомам лиганда присвойте один и тот же номер "остатка" (MODELLER считает, что один лиганд = один остаток) и модифицируйте имена атомов каждого остатка, добавив в конец буквы A, B, C. Смысл операции в том, что атомы остатка 130 имели индекс А, атомы остатка 131 имели индекс В и т.д. Пример: |Было: |Стало | ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>17994) - dualopt1.cmm.msu.ru/ )

• RibosmalS7 - Projects - TWiki
• RibosmalS7 - Projects - TWiki - (printable)
• %TOPICTITLE% (3 vs. 4) - TWiki

МАТЕМАТИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ ЛАМИНАРНО-ТУРБУЛЕНТНОГО ПЕРЕХОДА В ПОГРАНИЧНОМ СЛОЕ НА СФЕРЕ П.В. Матюшин , В.А . Гущин Институт автоматизации проектирования РАН , Москва Используя прямое численное моделирование (без введения каких либо моделей турбулентности) в настоящей работе удалось получить пространственный ламинарно-турбулентный переход Этому предшествовала длительная работа по уточнению классификации течений однородной вязкой жидкости около сферы в широком диапазоне Re. ... РАН. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>67) - hit-conf.imec.msu.ru/ )

• http://hit-conf.imec.msu.ru/2012/abstracts/AbbasovSukhinov.doc

... Астронет | ... Переменные Звезды | ... Для понимания природы источника в астрономии очень важно описать спектр объекта. ... С одной стороны, спектр вроде неплохо описывается простой моделью абсолютно черного тела. ... На рисунке показан спектр RX J0720.4-3125 и попытки его интерпретации. Авторы использовали двухкомпонентную модель спектра с учетом тонкой водородной атмосферы нейтронной звезды. ... Пунктиром показан тепловой спектр без учета атмосферы. ... Публикации со словами: нейтронные звезды . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>25167) - www.astronet.ru/ )

• Астронет > Форумы > Обсуждение публикаций Астронета > Моделирование прохождения
• Астронет > 1. Моделирование взрыва.
• Астронет > Моделирование прохождения Меркурия по диску Солнца

... Юрий (admin) Новости R , R tips. полезные советы , графика в R 2 Comments . При стандартном способе построения графиков они получаются не очень приятными для глаз. ... Сгенерируем данные . ... plot(x, y, main="Стандартный тестовый график \n Сглаживание отсутствует", pch=21, col="blue", bg="lightblue") . ... plot(x, y, main="Стандартный тестовый график \n Сглаживание используется", pch=21, col="blue", bg="lightblue") . ... Анализ и визуализация данных на языке R Динамика посещаемости блога . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>173) - tukachev.flogiston.ru/ )

• Tag: R
• Category: Новости
• Устнавливаем пакеты в новой копии R (на другом компьютере)

Заседание семинара по социофизике . ... These studies are based on the quantum-like paradigm (elaborated by the speaker): processing of information by complex context-sensitive systems has to be described by nonclassical probabilistic models: there is a plenty of statistical data which violate the laws of classical probability (or what is equivalent the laws of classical Boolean logic). ... Quantum-like modeling of cognition . ... Вебдизайн: Copyright (C) И. Миняйлова и В. Миняйлов . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>30) - www.soc-phys.chem.msu.ru/ )

... Суть технологии трехмерного геологического моделирования с использованием фациальных карт состоит в том, чтобы при моделировании литологии, использовать свертку карты типов разреза, которая характеризует фациальную (площадную) изменчивость, с геолого-статистическими разрезами (ГСР) фациальных типов, характеризующих распределение литологических типов в разрезе и, соответственно, вертикальную изменчивость (рис. ... Поэтому автором также разработан более простой путь учета литолого-фациальных моделей. ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>7898) - geo.web.ru/ )

• Геомиграционное моделирование переноса микробов и вирусов в подземных водах.
• Экспериментальное исследование и термодинамическое моделирование миграции
• Напряженное состояние литосферы Земли по результатам моделирования - Все о

RUSSIAN PEREPLET . Culture, Science, and Education Portal . Science Space Culture General Discussion Scientific Discussion Seminars . News: The best of Russian Science and Technology . ... MASTER Team Science Release: Discovery of the Black Hole Ergosphere? ... The International Conference "The International Conference" . ... MASTER is the first russian asteroid factory . ... New Russian "Volga" . ... MASTER - is the first russian robotic telescope for observations Gamma-Ray Bursts . ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>231) - www.pereplet.ru/ )

системы автоматизации, автоматизированные системы , информационные системы , мобильные и встраиваемые системы , программное обеспечение, вычислительные системы , средства связи,базы данных, информационные технологии,технологии программирования, обработка изображения, параллельные вычисления, информационное моделирование,математическое моделирование, вычислительный эксперимент, информатика,методы вычислений, численный анализ, numerical ...

Еще в разделе: (Показать все результаты (>152) - adept.srcc.msu.ru/ )

• Статическое задание параметров апплета
• Текст