... 1.Построение парного выравнивания исследуемого белка и заданного прототипа . ... Для сравнения последовательностей белка из БД UniProt и PDB было сделано парное глобальное выравнивание с помощью программы needle. ... Далее было сделано выравнивание последовательности заданного белка ( Q0EEG8 ) и белка-прототипа (из PDB). ... Разметка мембранных сегментов на выравнивании . На странице БД ОРМ, посвященной данному белку , можно найти данные о его ориентации в мембране. ... Полученное выравнивание: . ...