Критерий качества дерева в методе MP ? минимальное число мутаций, необходимое, чтобы получить данные последовательности по данному дереву. ... То дерево, для которого эта вероятность наибольшая, и есть максимально правдоподобное дерево. Метод наименьших квадратов минимизирует сумму квадратов разностей между расстояниями, поданными на вход, и расстояниями по дереву. Метод Фитча ? Марголиаша минимизирует сумму квадратов относительных разностей ((a?b)/a) . ...