... Введите в нужное поле код доступа Вашего белка в банке UniProt, затем нажмите кнопку Sequence SMART . ... В базах SMART и Pfam приведены ID белковых последовательностей, которые могли устареть. ... Нажмите <Ctrl+Q> (или в меню: Project Edit sequence list). Появится окошко для работы со списком последовательностей выравнивания. ... Сохраните выравнивание. Затем выберите фрагмент выравнивания длиной в 50?80 а.о. Остальные колонки выделите и удалите: Edit Select Columns; Edit Delete All Data. ...
... Эталонного выравнивания. ... Выравнивания с помощью ClustalW. ... Сделанное с ее помощью выравнивание фрагментов пяти последовательностей полностью идентично эталонному выравниванию тех же участков. ... Кроме того, разнятся и консенсусные последовательности:в эталонном выравнивании в ней только большие (если в столбце все пять остатков одинаковы) и маленькие (если только четыре) буквы, а в консенсусной последовательности ClustalW-выравнивания кроме этих символов есть еще и цифры. ...