... Материалы к занятию 14 . ... файл с "эталонным" множественным выравниванием домена (файл xxx.msf, созданный на занятии ? ... выравнивание пяти полных доменов, но можно использовать benchmark.msf; . матрица попарных совпадений последовательностей в этом выравнивании, см. дополнительное задание занятия ?10. ... Скопируйте матрицу попарных совпадений на лист, названный "Distances". ... Cкопируйте матрицу попарных эволюционных расстояний на новый лист, назовите лист "UPGMA". ...
... Построние матрицы "наивных" эволюционных расстояний между последовательностями "эталонного" множественного выравнивания домена . ... Построение дерева. ... ASPG4_SCHPO:19, ASPG2_YEAST:19):4, ASPG_MYCLE:23):9.25,(ASPG1_BACSU:28, GATD_METKA:28):32.25); Для выполнения использованы 2 программы из Online-версии пакета Phylip: drawtree и drawgram (все параметры по умолчанию). ... Изображение, полученное drawgram. ... Программа drawgram построила укорененное дерево, а программа drawtree - неукорененное. ...