... Создайте с помощью FAR Manager текстовой файл fullANDpart.fasta, в нем сохраните в формате FASTA первый фрагмент, а также полную последовательность заданного вам белка. Запустите программу GeneDoc и импортируйте полученный файл (см. подсказки к GeneDoc ). ... Определите номера позиций в полной последовательности, которым соответствуют первый и последний а.о. заданного фрагмента. ... Сохраните выравнивание под именем alignment1.msf в рабочей директории. ... Чем больше вес, тем лучше выравнивание! ...
... Определение положения фрагмента полной последовательности белка BCCP_ECOLI. ... Выравнивание двух фрагментов . C помощью редактора выравниваний GeneDoc были выравнены 2 последовательности: первая длиной 26а.о., а вторая длиной 25а.о. После выравнивания образовалось 10 колонок, выделенных черным цветом (это совпавшие элементы последовательностей), а длина выравнивания равна 26. ... У этого выравнивания длина равна уже 27 колонок, а процент идентичности последовательностей равен 11/27, т.е. 40,74%. ...