Идентификаторы заданного белка и белка-прототипа см. здесь . ... Поэтому получите и сравните обе последовательности белка-прототипа. ... Постройте парное выравнивание этой последовательности и последовательности белка-прототипа из PDB . ... Готовое выравнивание импортируйте в GeneDoc и сохраните в файле под названием marking.msf . ... Добавьте к последовательностям в файле marking.msf еще одну искусственную последовательность, отражающую результаты данного предсказания. ...
... AQP4_RAT 301 VIDIDRGDEKKGKDSSGEVLSSV 323 Итак, выравнивание построено; 2D57-SEQ - последовательность белка-прототипа из БД PDB; AQP4_RAT - последовательность белка-прототипа из БД UniProt (AQP4_RAT - это ID белка с АС P47863). ... Она синтезируется первой и необходима для верного "заякоривания" рибосом на мембране ЭПР и начала встраивания белка в мембрану, после чего "сигнальная последовательность" ферментативно удаляется в полости ЭПР. ... Всего аргинина в последовательности (число а.о.) . ...