Поиск по: -
Поискать по всем серверам
На этой странице приведены все страницы, которые ссылаются на http://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/year_04/doc/term3/fasta_man.txt. Показаны документы 1 - 2 из 2.
1. Help to practice 4 (MEGABLAST)
Скопируйте в рабочую директорию файл с аннотированным геномом E.coli (Р:/y05/Term3/ecoli.embl). С помощью команды grep найдите в этой записи строчки, в которых одновременно, но не подряд, встречаются слово codon и название нужной аминокислоты, перенаправьте вывод в файл. ... Подсказка: программа понимает спецсимволы . ... Выберите среди полученных строчек подходящую и проведите текстовой поиск этой строки в файле ecoli.embl. ... Поиск с помощью MegaBLAST и discontiguous MegaBLAST . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/year_05/term3/help4.html -- 8.1 Кб -- 26.09.2006
Похожие документы
Похожие документы
2. Fasta, MEGABLAST
... геном сенной палочки ( Bacillus subtilis ), см. ... Оказалось, что для кишечной палочки аннотирована тРНК с антикодоном gaa (2 записи в файле ecoli.embl; в таблицу занесена информация по обеим из них; предварительно проведен текстовой поиск в файле ecoli.embl). ... MegaBLAST . ... Получен файл , содержащий 4 выравнивания найденной тРНК и нескольких участков последовательности генома Bacillus subtilis (AL00912). ... Поиск с MegaBLAST: megablast -d bs -i u00096.fasta -D 2 -e 10.0 -o mblast_trna.txt . ...
[
Сохраненная копия
]
Ссылки http://kodomo.cmm.msu.ru/~igogo/Term3/task4.html -- 15.8 Кб -- 04.10.2006
Похожие документы
Похожие документы