... С помощью программы blastp были найдены его гомологи в организме Yersinia pestis (чумная палочка) и выбран один из них c ID 86%. ... Затем построены попарные белковое и нуклеотидное выравнивания с помощью программы needle с параметрами по умолчанию. ... PAL2NAL - это программа, которая преобразует множественное выравнивае белков и соответствующих ДНК в покодонное выравнивание. ... С помощью этой программы было получено выравнивание с разбивкой на кодоны (формат выдачи codon with aminoacid). ...