состоит в том ,что бы построить выравнивание двух данных фрагментов последовательностей гомологичных белков - поринов (порины образуют поры во внешней мембране грамотрицательных бактерий) программой полного парного выравнивания с биологически обоснованным выравниванием построенным при рассмотрении расположения данных фрагментов в пространстве. ... Близкие друг другу C?-атомы определят консервативные аминокислоты, которые в биологически обоснованном выравнивание должны располагаться одна под другой . ...