... Была найдена SMILES аннотация для NAG - nag.smi . ... Для докинга необходимо указать область структуры белка в которой будет происходить поиск места для связывания. ... Энергия 3ех лучших расположений и геометрическая разница между ними (из файла nag_prot.log): mode | ... rmsd l.b.| rmsd u.b. -----+------------+----------+---------- 1 -5.7 0.000 0.000 2 -5.5 1.821 3.008 3 -5.1 1.916 2.680 . ... При помощи скрипта был проведен обыкновенный докинг и докинг с подвижными радикалами для этих лигандов. ...