... Пакет программ Gromacs предоставляет много инструментов для анализа траекторий и свойств динамики. Суть любого анализа сводится к пониманию специфики динамики конкретной системы. Результаты анализа выдаваемые GROMACS имеют расширение xvg (программа GRACE), но формат самих файлов текстовой, так что построение графиков можно делать в gnuplot,excel. ... алгоритм минимизации: integrator = l-bfgs . ... Начнем с визуального анализа движений молекул (группа DPPC): . ... Запустим анализ. ...