... Цель: ознакомится с возможностями докинга низкомолекулярного лиганда в структуру белка. ... Программе Autodock Vina для докинга необходимы специально форматированные файлы pdb c зарядами и указанием торсионных углов. ... Теперь надо создать файл с параметрами докинга vina.cfg. Для докинга необходимо указать область структуры белка, в которой будет происходить поиск места для связывания. ... 0.000 (best mode 0.000) . ... Файлы обычного докинга для OH: . ... Файлы обычного докинга для NH2: . ...