... Далее было получено множественное выравнивание данных последовательностей, для него программой eprotdist была построена матрица попарных расстояний, и с помощью программы eneighbor пакета программ EMBOSS было получено филогенетическое дерево: . ... Синим выделены паралоги; паралогами считались белки из одного организма, но находящиеся на разных кладах дерева (Однако две последоваательнеости на одной кладе будут являться ортологами, если они из разных организмов, и паралогами, если из одного). ...