... После чего переходите в режим редактуры остатков (Edit Residue Mode) и отметьте позиции мембранных сегментов буквой "Н", позиции цитоплазматических петель знаком "+", остальные ? ... При разметке исследуемой последовательности по ОРМ помните, что нумерация в ОРМ соответствуют нумерация последовательности белка-прототипа в PDB !! ... По умолчанию, его размер обычно - 9 а.о. Программа просматривает всю а.к.последовательность и для каждого окна вычисляет среднее значение гидрофобности. ...
Стандартные названия канонических аминокислот . Структурные формулы канонических аминокислот . Классы канонических аминокислот . Классификация канонических аминокислот в виде диаграммы . "Общепринятое" мнение о свойствах боковых цепей (R-групп) аминокислот . Молекулярная масса канонических аминокислот . Разные оценки гидрофобности боковых цепей (R-групп) . рКа полярных групп в боковых цепях . Частоты встречаемости аминокислот . Для тех, кому интересно ? полезный адрес .