... Выравнивание в формате msf с размеченными кластерами плюс-блоков и выделенными функционально консервативными позициями . ... Пары структур: . ... 1a.(*) Описать различия в результатах гибкого выравнивания структур из задания 1 и жесткого выравнивания структур. 1b.(*) Проверить выравнивание последовательностей, полученное в результате выполнения задания 1, по структурным данным с помощью сервиса Geometrical Core (Б.Нагаев) . ... Сервис FATCAT (парное гибкое выравнивание) - сервис первого выбора : . ...
. Выравнивание по первому домену (rmsd=0.497) . Выравнивание по второму домену (rmsd=0.531) . Выравнивание по третьему домену (rmsd=0.557) . (На всех изображениях первый домен красный, второй - синий, третий - зеленый; 1HY0 - черная и ярко красная, зеленая и синяя, 1I0A - белая и красная, зеленая и синяя с непривычным оттенком) . Совмещение по геометрическому ядру (rmsd=0.865) . Совмещение по полным цепям с помощью команды align (rmsd=3.088) . 2010