|
Бажанова З.Г., Хренова М.Г., Немухин А.В. Расчеты взаимодействий в биомолекулярных системах: сравнение квантовых и классических подходов // Вычислительные методы и программирование. 2011. Том 12, номер 2. 298 - 302
Рассматриваются методические вопросы применения методов молекулярной механики, квантовой химии и комбинированного метода квантовой механики/молекулярной механики (КМ/ММ) к расчетам межмолекулярных взаимодействий ряда аминокислот (аргинина, гистидина и серина) с молекулами воды. Расчеты выполнены на суперкомпьютере СКИФ МГУ "Чебышев" с использованием приближений теории функционала электронной плотности в квантовых подсистемах. По результатам расчетов сформулированы практические рекомендации для оценок энергетической стабильности межмолекулярных комплексов. Работа выполнена при поддержке РФФИ (код проекта 10-01-00297а
Ключевые слова:
квантово-химические расчеты, метод КМ/ММ, межмолекулярные взаимодействия
|