Монте-Карло в пространстве последовательностей аминокислот.

В ряде случаев метод Монте-Карло применяется для нахождения последовательностей с заданными динамическими свойствами (быстро сворачивающихся). Например, Метод Монте-Карло применялся для поиска не в пространстве конформаций, а в пространстве аминокислотных последовательностей. В процессе расчета генерируются мутации, они принимаются или отвергаются в соответствии с критерием Метрополиса, где роль энергии играет отличие динамических свойств пептида от требуемых свойств.

Литература:

1. Gutin A.M., Abkevich V.I., Shakhnovich E.I. Evolution-like selection of fast-folding model proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, V.92, P. 1282-1286, 1995.

<< Назад || Вперед >>

Обратно в оглавление