npidb:// home / introduction

Nucleic Acid – Protein Interaction DataBase (NPIDB) project

От авторов проекта

Мы исходим из того, что имеется потребность в удобном представлении информации обо всех трехмерных структурах комплексов, в которых белок связывается с ДНК или РНК.

Первым вариантом нынешней NPIDB была созданная нами реляционная база данных DPIDB (DNA-protein interaction database), созданной нами (Биофизика, 2001). Исходными данными для NPIDB являются ДНК-белковые и РНК-белковые комплексы, хранящиеся в Protein Data Bank (PDB). Описание текущего варианта опубликовано в журнале "Bioinformatics", т.23 (2007) (аннотация).

Все замечания, дополнения, предложения и пожелания в высшей степени приветствуются

Мы стремимся, чтобы:

1. Пользователь, интересующийся структурными аспектами взаимодействия белков с НК, мог легко и просто получить достаточно полную картину современного состояния области.
2. Пользователь, профессионально занимающийся структурными аспектами специфического взаимодействия белков с НК получил доступ к структурированной информации обо всех ДНК-белковых и РНК-белковых комплексах, представленных в банках PDB и NDB, а также к специализированным программам работы со структурами.
3. Пользователь получил оперативный доступ к результатам наших исследований.

Группа разработчиков:
А.В. Алексеевский, А.С. Карягина, С.А. Спирин

Бывшие члены группы, внесшие большой вклад в разработку проекта:
С.А. Васильев, Р.К. Леднева, M.Л. Титов

Проект поддержан грантами РФФИ 06-07-89143 и 06-04-49558, а также грантом INTAS 05-1000008-8028

© NPIDB

Last modified:  July 2008

All material on this page is property of NPIDB project team.