Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://polly.phys.msu.ru/en/seminar/lifshitz/abstracts/361.html
Дата изменения: Unknown
Дата индексирования: Mon Oct 1 22:07:17 2012
Кодировка: koi8-r
Seminar in Polymer Physics

Statistical physics of RNA secondary structures and the role of the RNA alphabet size

Dr M. Tamm (MSU)

Abstract

Доклад посвящен статистической теории образования вторичной структуры в комплексах РНК. Автор начнёт с обсуждения общей теории образования кактусоподобных вторичных структур РНК и того, как эта теория может быть обобщена на образование РНК-РНК комплексов. Далее, для простейшей модели связывания будет описан алгоритм, позволяющий предсказывать вторичные структуры комплексов РНК по заданной первичной структуре компонент за время порядка N4.

Во второй части доклада автор обсудит статистические свойства вторичных структур случайных РНК и покажет возможность существования двух типов различных морфологий этих вторичных структур, т.н. совершенной и несовершенной, в зависимости от размера «алфавита РНК» (числа различных нуклеотидов). Будет показано, что в простейшей модели формирования вторичных структур переход от совершенных к несовершенным структурам происходит при числе нуклеотидов, равном 4.