Типы молекулярного движения. Взаимопревращения различных типов
молекулярного движения. Спектральные методы исследования.
Спектральные плотности молекулярного движения.
Теорема Винера-Хинчина. Временные корреляционные функции.
Физический смысл спектральной плотности и временных корреляционных
функций.
Теория линейного отклика. Функции отклика и комплексная
восприимчивость. Физический смысл действительной и мнимой части
комплексной восприимчивости. Соотношения Крамерса-Кронига.
Флуктуационно-диссипационная теорема (без вывода).
Пример применения ФДТ для газа дипольных частиц. Связь спектральных
плотностей с экспериментально определяемыми величинами.
Примеры спектральных методов.
Основные теоретические методы вычисления временных корреляционных
функций. Метод молекулярной динамики и метод броуновской динамики.
Ограничения метода молекулярной динамики.
Основные подходы метода частиц в активном термостате.
Модельный подход: преимущества, недостатки, примеры.
Многовременные условные вероятности случайного процесса.
Марковские процессы. Уравнение Колмогорова-Чепмена.
Вывод уравнения Фоккера-Планка (УФП). Основные допущения при
выводе УФП.
Сопряженное уравнение Фоккера-Планка. Физический смысл
различных членов в УФП и в сопряженном уравнении Фоккера-Планка.
Стационарное решение. Распределение Максвелла.
Решение уравнения Фоккера-Планка (общий подход к решению,
без вывода). Вычисление временных корреляционных функций.
Связь уравнений Фоккера-Планка и Ланжевена. Аддитивный и
мультипликативный шум. Проблема интерпретации уравнений.
Формы Ито и Стратоновича уравнения Фоккера-Планка для
мультипликативного шума.
Условия передемфированного движения. Уравнение Смолуховского.
Соотношение Эйнштейна для коэффициента диффузии. Подвижность.
Плотность потока вероятности. Оценка тока протонов в наномоторе
жгутиковой бактерии.
Безмодельный подход: Обобщенное уравнение Ланжевена.
Разделение движения на "релевантное" и "нерелевантное".
Проекционные операторы их свойства и физический смысл.
Формализм "бра" и "кет" векторов для
проекционных операторов. Оператор Лиувилля системы, его свойства.
Вывод обобщенного уравнения Ланжевена. Функция памяти.
Связь функции памяти с коррелятором случайной силы.
Немеханический характер пропагатора случайной силы.
Иерархия кинетических уравнений. Иерархия функций памяти,
проекционных операторов и случайных сил. Применение формализма
для случая, когда случайной величиной является скорость.
Иерархия цепных дробей Мори. Метод обрыва цепной дроби.
Иллюстрация метода для обрыва цепной дроби на 1-ом, 2-ом, n-ом шаге.
Временные корреляционные функции. Метод модельной функции памяти.
Времена корреляции и коэффициенты трасляционной и вращательной
диффузии. Соотношения Эйнштейна и Стокса-Дебая-Эйнштейна.
Основные временные корреляционные функции вращательного движения.
Теорема сложения для сферических гармоник (без вывода).
Теорема Хаббарда (без вывода).
Одномерный ротатор. Условие расцепления корреляций. Связь
корреляционных функций угловой скорости и ориентации молекулы в
общем случае. Соотношение Хаббарда. Дебаевское время релаксации,
его оценка для жидкой воды.
Молекулярное движение в газах. Среднее время и длина свободного
пролета. Вычисление временных корреляционных функций скорости и
угловой скорости для газа. Параметр сохраняемости.
Времена корреляции.
Вычисление временной корреляционной функции ориентации для
линейных молекул в газах. Временная корреляционная функция свободных
ротаторов. Предел малых поворотов и соотношение Хаббарда.
Модель твердых сфер. Операторы Лиувилля и бинарных соударений.
Метод кумулянтов для вычисления временных корреляционных функций.
Метод некоррелированных последовательных бинарных соударений (НПБС).
Модели гладких и шероховатых сфер, времена корреляции для
этих моделей.
Вычисление временной корреляционной функции ориентации для
линейных молекул с использованием приближения (НПБС).
Соотношение Хаббарда и условие его справедливости.
Применение модели твердых сфер для описания кинетики жидкости.
Зависимость коэффициента диффузии от плотности. Сравнение временных
корреляционных функций для модели твердых сфер с последними для
плотной жидкости с реалистичным потенциалом.
Коллективные моды в жидкости. Структурный фактор и промежуточная
функция рассеяния. Обобщенное уравнение Ланжевена для коллективных мод.
Связь микроскопических мод и макроскопических гидродинамических
переменных.
Уравнения непрерывности, Навье-Стокса и флуктуационной
гидродинамики для потоков. Вычисление промежуточной
функции рассеяния.
"Длинные хвосты" корреляционных функций. Асимптотика
временной корреляционной функции скорости молекулы при больших
временах. Связь асимптотики с размерностью. Проблема расходимости
кинетических коэффициентов в системах низкой размерности.
Граничные условия в гидродинамике. Вычисление коэффициента
вращательного трения в среде с переменной вязкостью. Формулы Стокса.
Формулы Перрена для ориентационного движения эллипсоида в жидкости.
Обобщение формулы Эйнштейна для эллипсоида. Микроскопические модели
граничных условий.
Влияние электростатических взаимодействий на молекулярное движение
в растворах. Электростатическая составляющая тензора напряжений.
Уравнения Хаббарда-Онзагера для жидкости состоящей из полярных молекул.
Диэлектрическое трение. Коэффициента трения для вращающегося диполя
и иона и движущегося иона.
Понятие о предмете наномеханики. Условия получения полезной
работы за счет тепловых флуктуаций. Рэтчет Смолуховского-Фейнмана.
Демон Максвелла. Выполнение II-го закона термодинамики для рэтчета
Смолуховского-Фейнмана (количественный анализ).
Общее уравнение Фоккера-Планка для рэтчетов и основные типы
рэтчетов. Пульсирующий рэтчет. Оценка средней скорости частицы
в пульсирующем рэтчете с регулярным телеграфным сигналом.
Температурный рэтчет. Инверсия потока в температурном рэтчете
и его использование для сегрегации частиц по размерам.
Количественный анализ пульсирующих рэтчетов на примере рэтчета
со случайно флуктуирующим кусочно-линейным барьером. Параметр
асимметрии рэтчета. Система уравнений Фоккера-Планка. Метод решения
уравнений. Зависимость скорости от частоты флуктуаций барьера.
Качающиеся рэтчеты. Скорость частицы для качающегося рэтчета
в адиабатическом приближении. Движение частицы под действием
гармонической силы. Зависимость скорости частицы от характерной
частоты случайной силы.
Динамическая модель протеосомы. Вывод уравнения Фоккера-Планка
для движения полипептидной цепи в протеосоме. Температурный
диапазон эффективной работы протеосомы.
Наномоторы. Основные типы наномоторов. Электронаномоторы на
основе нанотрубок, примеры и возможное применение. Биологические
и гибридные наномоторы, примеры и характерные параметры. Особенности
функционирования наномоторов.
Понятие о механохимической связи. Координата реакции.
Вывод констант скорости реакции через параметры потенциала средней
силы. Изменение свободной энергии Гиббса химической реакции. Двумерный
механохимический потенциал. Направленное движение в механохимическом
цикле.
Рекомендуемая литература:
Молекулярная кинетика:
Бриллиантов Н.В., Ревокатов О.П. Молекулярная
динамика неупорядоченных сред, Изд. Моск. Университета, М. 1996.
(есть в библиотеке физфака, продается в киоске
физфака)
Ван Кампен Н.Г. Стохастические процессы в
физике и химии, М.: Высш. шк., 1990. (есть в библиотеке
физфака)
Балеску Р. Равновесная и неравновесная
статистическая механика, М.: Мир, 1978. Т.1,2. (есть в
библиотеке физфака)
Крокстон К. Физика жидкого состояния,
М.: Мир, 1978. (есть в библиотеке физфака)
Наномеханика:
Reiman P. Brownian motors: noisy transport far from equilibrium.
Phys.Rep. (2002) 361, 57-265.
Keller D. and Bustamante C. The Mechanochemisry of molecular
motors. Biophysical Journal (2000) 78,
541-556.