Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.fbb.msu.ru/~sorochkinaa/term4/syymhuman_syyecoli.html
Дата изменения: Mon Mar 26 23:01:24 2007
Дата индексирования: Mon Oct 1 22:23:22 2012
Кодировка:
Query Results
Header
Program needle
Rundate Mon Mar 26 2007 17:44:30
Align format srspair
Report file temp_job2.needlep
Results
 
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: SYYM_HUMAN
# 2: SYY_ECOLI
# Matrix: EBLOSUM62
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 324
# Identity:     131/324 (40.4%)
# Similarity:   185/324 (57.1%)
# Gaps:          45/324 (13.9%)
# Score: 619.5
# 
#
#=======================================

SYYM_HUMAN         1 ------QTIYCGFDPTADSLHVGHLLALLGLFHLQRAGHNVIALVGGATA     44
                           ..:||||||||||||:|||:.||.|...|:|||..:|||||||.
SYY_ECOLI          1 RLAQGPIALYCGFDPTADSLHLGHLVPLLCLKRFQQAGHKPVALVGGATG     50

SYYM_HUMAN        45 RLGDPSGRTKEREALETERVRANARALRLGL-----------EALAANHQ     83
                     .:||||.:..||:....|.|:.....:|..:           .|:|||  
SYY_ECOLI         51 LIGDPSFKAAERKLNTEETVQEWVDKIRKQVAPFLDFDCGENSAIAAN--     98

SYYM_HUMAN        84 QLFTDGRSWGSFTVLDNSAWYQKQHLVDFLAAVGGHFRMGTLLSRQSVQL    133
                                     |..|:...:::.||..:|.||.:..::::::|:.
SYY_ECOLI         99 ----------------NYDWFGNMNVLTFLRDIGKHFSVNQMINKEAVKQ    132

SYYM_HUMAN       134 RL-KSPEGMSLAEFFYQVLQAYDFYYLFQRYGCRVQLGGSDQLGNIMSGY    182
                     || :..:|:|..||.|.:||.|||..|.::||..:|:|||||.|||.||.
SYY_ECOLI        133 RLNREDQGISFTEFSYNLLQGYDFACLNKQYGVVLQIGGSDQWGNITSGI    182

SYYM_HUMAN       183 EFINKLTGEDVFGITVPLITSTTGAKLGKSAGNAVWLNRDKTSPFELYQF    232
                     :...:|....|||:||||||...|.|.||:.|.||||:..||||::.|||
SYY_ECOLI        183 DLTRRLHQNQVFGLTVPLITKADGTKFGKTEGGAVWLDPKKTSPYKFYQF    232

SYYM_HUMAN       233 FVRQPDDSVERYLKLFTFLPLPEIDHIMQLHVKEPERRGPQKR----LAA    278
                     ::...|..|.|:||.|||:.:.||:.:.:    |.:..|...|    ||.
SYY_ECOLI        233 WINTADADVYRFLKFFTFMSIEEINALEE----EDKNSGKAPRAQYVLAE    278

SYYM_HUMAN       279 EVTKLVHGREGLDSAKRCTQALYH    302
                     :||:||||.|||.:|||.|:.|: 
SYY_ECOLI        279 QVTRLVHGEEGLQAAKRITECLF-    301


Additional Information