|
Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес
оригинального документа
: http://kodomo.fbb.msu.ru/~sorochkinaa/term4/syymhuman_metja.html
Дата изменения: Mon Mar 26 23:05:24 2007 Дата индексирования: Mon Oct 1 22:19:29 2012 Кодировка: |
| Header | |||
| Program | needle | ||
| Rundate | Mon Mar 26 2007 17:55:20 | ||
| Align format | srspair | ||
| Report file | temp_job3.needlep | ||
| Results | |||
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: SYYM_HUMAN
# 2: SYY_METJA
# Matrix: EBLOSUM62
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 341
# Identity: 73/341 (21.4%)
# Similarity: 125/341 (36.7%)
# Gaps: 107/341 (31.4%)
# Score: 154.0
#
#
#=======================================
SYYM_HUMAN 1 -QTIYCGFDPTADSLHVGHLLALLGLFHLQRAGHNVIALVGGATARLGDP 49
::.|.||:|:. .:|:||.|.:..:..||.||.::|.|:....|.|...
SYY_METJA 1 EKSAYIGFEPSG-KIHLGHYLQIKKMIDLQNAGFDIIILLADLHAYLNQK 49
SYYM_HUMAN 50 SGRTKEREALETERVRANARALRLGLEALAANHQQLFTDGRSWGSFTVLD 99
. |.:.:|......:...||:....:.:: ||...||
SYY_METJA 50 G---------ELDEIRKIGDYNKKVFEAMGLKAKYVY------GSEFQLD 84
SYYM_HUMAN 100 NSAWYQKQHLVDFLAAVGGHFRMG--TLL--SRQSVQLRLKSPEGMSLAE 145
. |:...| :|:. |.| :|:|::|..:..|...:||
SYY_METJA 85 K----------DYTLNV---YRLALKTTLKRARRSMELIAREDENPKVAE 121
SYYM_HUMAN 146 FFYQVLQAYDFYYLFQRYGCRVQLGGSDQLGNIMSGYEFINKLTGEDVFG 195
..|.::|..|.:|| |..|.:||.:|....|...|.:.| .|..
SYY_METJA 122 VIYPIMQVNDIHYL----GVDVAVGGMEQRKIHMLARELLPK----KVVC 163
SYYM_HUMAN 196 ITVPLITSTTG-AKLGKSAGNAVWLNRDKTSP------------------ 226
|..|::|...| .|:..|.||.:.:: .||
SYY_METJA 164 IHNPVLTGLDGEGKMSSSKGNFIAVD---DSPEEIRAKIKKAYCPAGVVE 210
SYYM_HUMAN 227 ----FELYQFFVRQP-----------DDSVERYLKLFTFLPLPEIDHIMQ 261
.|:.::|:..| |.:|..|.:|.:.....|: |.|.
SYY_METJA 211 GNPIMEIAKYFLEYPLTIKRPEKFGGDLTVNSYEELESLFKNKEL-HPMD 259
SYYM_HUMAN 262 LHVKEPERRGPQKRLAAEVTKLVHGREGLDSAKRCTQALYH 302
| :..:|.|:.|::.
SYY_METJA 260 L----------KNAVAEELIKILE----------------- 273
|
|||
| Additional Information | |||
![]() |
Terms of Use
Feedback & Support
SRS Release 7.1.3.2
Copyright
© 1997-2003 LION bioscience AG. All Rights Reserved. |
![]() |