Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.fbb.msu.ru/~podkovkina/Protokol.doc Дата изменения: Mon Dec 25 19:58:25 2006 Дата индексирования: Mon Oct 1 20:07:07 2012 Кодировка: koi8-r

Анализ протеома бактерии Thermotoga maritima

Подковкина Анна, студент 1 курса


Введение.

[Русское название]
Русское название бактерии Thermotoga maritima -Термоустойчивая палочка.

[Таксономия]
Вид Thermotoga maritima относят к роду Thermotoga, семейству
Thermotogaceae, порядку Thermotogales, классу Thermotogae, царству
Bacteria [1]

[pic]

[Среда (среды) обитания и условия]
Бактерия обитает в зоне повышенных температур, т.е. в термальных
источниках, где температура достигает 80-90 градусов цельсия
[Чем интересна человеку, почему ее геном секвенирован]
Эта бактерия интересна тем, что она способна выдерживать высокие
температуры. Её мембрана устроена так, что для бактерии лучшие условия для
существования- это 60-70 градусов Цельсия. Изучение свойств её мембраны
может помочь человеку в промышленности.

Геном и протеом T.thermophilus


[Статистические данные о геноме]
Статистические данные о геноме приведены в табл.1 Они взяты с сайта
http://www.ebi.ac.uk/integr8/OrganismStatsAction.do;jsessionid=E8D7F81C6838F
57F8B389F2CE9CAB275?orgProteomeId=1244

Табл.1 Статистические данные о геноме T.thermophilus
|Хромосома |Число пар |Число генов |Суммарная |Суммарная |GC |
|или плазмида|нуклеотидов | |длина генов |длина |conten|
| | | |(% от длины |межгенных |t (%) |
| | | |хромосомы |промежутко| |
| | | |или |в (%) | |
| | | |плазмиды) | | |
|хр.1 |1894877 |1981 |96% |4% |69.4% |
|кольцевая | | | | | |
|плазмида |232605 |228 |89% |11% |69.2% |
|pTT27 | | | | | |
|кольцевая | | | | | |
|(*) Всего |2127482 |2209 | | | |

Самый маленький белок 16 аминокислотных остатков
Самый длинный белок около 1770 а.о.
Средняя длина белков в бактерии в бактерии находится в промежутке между
100 и 400 а.о.

Ссылка на сайт, где хранятся статьи про мою бактерию.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?CMD=search&DB=pubmed/

На этом сайте можно найти 43 статьи про мою бактерию, где она упоминается в
заголовке, и которые написаны в 2006 году (запрос : Thermotoga maritima[Ti]
AND 2006[edat])
К примеру, в статье [1] рассказывается о особенностях ферментов бактерии
Thermotoga maritime.
Статья:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=pubmed&cmd=Retrieve&dopt=Ab
stractPlus&list_uids=17172017&query_hl=3&itool=pubmed_docsum

Литература
1. Автор Wei Sheng Wu Xue Bao. Его статья опубликована 5 октября 2006
года в Китае