Электронная плотность

 
В записи PDB 2B5A глутамин 21 цепи C изображен в двух разных конформациях (кэффициенты заполнения для атомов боковой цепи равны 0.5). 
Я скачала с сайта EDS файл omap с картой электронной плотности для данной записи и получила 
изображение электронной плотности данного остатка.



Желтым раскрашена поверхность уровня 1, а белым - уровня 0.5. Заметно, что одна конформация лучше вписывается в электронную плотность, чем вторая.
А вот изображение поверхности электронной плотности вокруг "нормального" остатка глутамина из цепи А.
  


Поверхность ЭП вокруг атома CG выражена слабо (видна только поверхность уровня 0.5): возможно, именно это создает неоднозначность при вычислении координат.

Изображение электронной плотности для остатка фенилаланина 512 из записи 1FL2.