Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.fbb.msu.ru/~haretsuon/term6/Prac2/script.txt Дата изменения: Tue May 22 15:24:12 2012 Дата индексирования: Tue Oct 2 11:01:05 2012 Кодировка:

frag ala
python
for x in range(2,100):
curr = "/ala///ALA`" + str(x) + "/"
cmd.edit(curr+"c")
editor.attach_amino_acid("pk1","ala") # In Edit Mode, (pk1) is the first atom you 'pick' with the mouse.
for x in range(3,100):
prev = "/ala///ALA`" + str(x-1) + "/"
curr = "/ala///ALA`" + str(x) + "/"
next = "/ala///ALA`" + str(x+1) + "/"
cmd.set_dihedral(prev+"c", curr+"n", curr+"ca", curr+"c", -60.0) #phi
cmd.set_dihedral(curr+"n", curr+"ca", curr+"c", next+"n", -45.0) #psi
python end
orient