На данной странице предоставлены результаты выполнения заданий второго занятия, посвященного поисковым системам. На этом занятии рассматриваются такие поисковые системы, как SRS, MRS и UniProt. SRS посвящены все задания, остальным же лишь первые два. Итак:

1. Сравнение трех видов поисковых систем.

   Я не буду описывать ощущения на сайте, так как можно все прочитать тут

2. Эксперименты с запросами в полях поисковой системы SRS

   Эксперимент содержит в себе три части, завязанные на гамма-протеобактериях. Подробно ознакомиться с задачей вы можете здесь

   Результаты же можно прочесть тут: Протокол

3. Исследование белка xynD_Bacsu в поисковой системе SRS

   Формулировка функции белка	Строка запроса	Количество найденных документов
   thereby assisting in arabinoxylan (AX) and short- chain arabinoxylo-oligosaccharide (AXOS) degradation	([swissprot-Taxonomy:Gammaproteobacteria*] & ((([swissprot-Comment:Xylan*] & [swissprot-Comment:degradation*]) | [swissprot-Comment:Xylan degradation*]) > parent ))	1
   Cleaves arabinose units	(([swissprot-Taxonomy:Gammaproteobacteria*] & ([swissprot-Comment:Cleaves*] > parent )) & ([swissprot-Comment:units*] > parent ))	39
   assisting in degradation	([swissprot-Taxonomy:Gammaproteobacteria*] & ((([swissprot-Comment:Glycan*] & [swissprot-Comment:degradation*]) | [swissprot-Comment:Glycan degradation*]) > parent ))	205
   Hydrolysis of terminal non-reducing alpha-L- arabinofuranoside residues in alpha-L-arabinosides	((((([swissprot-Comment:non-reducing*] & [swissprot-Comment:alpha-L-*]) & [swissprot-Comment:arabinofuranoside*]) | [swissprot-Comment:non-reducing alpha-L- arabinofuranoside* ]) > parent ) & [swissprot-Taxonomy:Gammaproteobacteria*])	1

4. Сохранение данных в fasta-формате

   Собственно тут