Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/raw-rev/ec61e31eef46
Дата изменения: Unknown
Дата индексирования: Tue Oct 2 07:48:24 2012
Кодировка: UTF-8

# HG changeset patch
# User Boris Nagaev
# Date 1330806614 -14400
# Node ID ec61e31eef469c94ae8f2383003fcda77244fddd
# Parent 93506ab4934890144d83dc9513ae767ed5b8220d
pair-cores/web: add contents from blocks3d web interface

diff -r 93506ab49348 -r ec61e31eef46 pair_cores/web/approot/locales/pair-cores-web.xml
--- a/pair_cores/web/approot/locales/pair-cores-web.xml Sun Mar 04 00:04:28 2012 +0400
+++ b/pair_cores/web/approot/locales/pair-cores-web.xml Sun Mar 04 00:30:14 2012 +0400
@@ -19,6 +19,31 @@
Bron-Kerbosh (pair cores) timeout (-1 - unlimited)


+

PairCores


+
+ Here is an example of an alignment for input for the program:
+
+
+ 


+>1PER_L

+SISSRVKSKRIQLGLNQAELAQKVGTTQQSIEQLENGKTK-RPRFLPELASALGVS

+VDWLLNGT

+>1PER_R

+SISSRVKSKRIQLGLNQAELAQKVGTTQQSIEQLENGKTK-RPRFLPELASALGVS

+VDWLLNGT

+>1ADR_A_1

+LMGERIRARRKKLKIRQAALGKMVGVSNVAISQWERSETEPNGENLLALSKALQCS

+PDYLLKGD

+>1ADR_A_2

+LMGERIRARRKKLKIRQAALGKMVGVSNVAISQWERSETEPNGENLLALSKALQCS

+PDYLLKGD

+

+
+
+ The work was partly supported by
+ the Russian Foundation for Basic Research, grant 09-04-92743
+
+
Text file with high blocks
HTML file with high blocks
Homology file
diff -r 93506ab49348 -r ec61e31eef46 pair_cores/web/approot/locales/pair-cores-web_ru.xml
--- a/pair_cores/web/approot/locales/pair-cores-web_ru.xml Sun Mar 04 00:04:28 2012 +0400
+++ b/pair_cores/web/approot/locales/pair-cores-web_ru.xml Sun Mar 04 00:30:14 2012 +0400
@@ -26,6 +26,14 @@
Пропускать ядра, входящие в один элемент вторичной структуры


+
+ Пример входного выравнивания для программы:
+
+
+ Работа частично поддержана
+ Российским Фондом Фундаментальных Исследований, грант 09-04-92743
+
+
Вертикальные блоки (текст)
Вертикальные блоки (HTML)
Файл гомологии
diff -r 93506ab49348 -r ec61e31eef46 pair_cores/web/pair-cores.cpp
--- a/pair_cores/web/pair-cores.cpp Sun Mar 04 00:04:28 2012 +0400
+++ b/pair_cores/web/pair-cores.cpp Sun Mar 04 00:30:14 2012 +0400
@@ -5,6 +5,7 @@
#include
#include
#include
+#include
#include

#include "wc/src/Wbi.hpp"
@@ -53,6 +54,9 @@
"wc-locales/wtclasses");
messageResourceBundle().use(Wt::WApplication::appRoot() +
"locales/pair-cores-web");
+ //
+ new Wt::WTemplate(tr("pair.main.Header"), root());
+ //
TableTask* task = new TableTask(root());
//
TextFileInput* input_markup = new TextFileInput("-m");
@@ -136,6 +140,11 @@
task->set_queue(&queue);
task->set_validator(boost::bind(validate, task, input_markup, input_aln));
new TaskCountup(task, root());
+ //
+ new WBreak(root());
+ new Wt::WTemplate(tr("pair.main.Example"), root());
+ new Wt::WTemplate(tr("pair.main.Example_fasta"), root());
+ new Wt::WTemplate(tr("pair.main.Rfbr"), root());
}

WApplication* createPairCoresApp(const WEnvironment& env) {