Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/StudentScience/diplom_2008/radukhin.doc Дата изменения: Thu May 8 12:45:10 2008 Дата индексирования: Tue Oct 2 12:18:58 2012 Кодировка: koi8-r

Изучение структурных особенностей ассоциации белков оболочки вируса гриппа
в составе рафтовых липид-белковых комплексов.


Руководители: н.с., к.х.н. Радюхин В.А. и с.н.с., к.х.н. Ксенофонтов
А.Л.,
отдел хроматографии НИИ ФХБ им. А.Н.Белозерского

Молекулярная архитектура вирионов оболочечных вирусов представляет
собой пример высоко организованного макромолекулярного комплекса,
устойчивость и функциональность которого достигается высочайшей степенью
специфичности взаимодействия всех компонентов вируса. Изучение особенностей
структурной организации липид-белковых и белок-белковых взаимодействий
имеет круциальное значение для понимания процесса молекулярных перестроек в
вирионе, приводящем к инфицированию клетки.
Предлагается принять участие в разрешении важнейшей, но пока еще слабо
понимаемой роли взаимодействий матриксного М1 белка вируса гриппа с
липидными компонентами вирусной мембраны и с трансмембранными пептидными
фрагментами поверхностных гликобелков гемагглютинина и нейраминидазы,
заякоренных в мембрану.
В основе методологии лежат современные представления о необычной
рафтовой природе вирусной бислойной мембраны и об особенностях
взаимодействия белков мембранного протеома в комплексе со специфическими
липидными компонентами мембраны. Липид-белковый комплекс, получающийся в
результате специфической рафтовой солюбилизации фрагментов оболочки вируса
гриппа, является оригинальной находкой лаборатории и дает новые возможности
в изучении указанных проблем. Компьютерные расчеты вариантов вторичной и
третичной структур белка М1 с применением новейших представлений
структурной белковой химии и соответствующих алгоритмов предполагается
использовать вместе с экспериментальными данными для выяснения вклада
электростатических и гидрофобных взаимодействий белка М1 с липидным бислоем
и с трансмембранными фрагментами гемагглютинина и нейраминидазы.
Для выполнения экспериментальной части работы предполагается
использовать современные физико-химических методы: масс-спектрометрию,
малоугловое рассеяние рентгеновских лучей и динамическое светорасеяние,
электронную микроскопию, тритиевую бомбардировку вирионов и другие. Широко
представлен в лаборатории биохимический инструментарий: электрофорез белков
в геле, техника выделения фрагментов биомембран (рафтов), высокоэффективная
жидкостная хроматография и аминокислотный анализ. Для моделирования
пространственной структуры белка предполагается использование специальных
программ.