Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/StudentScience/themes_2008s/Tsaplina.doc Дата изменения: Wed Feb 20 13:19:37 2008 Дата индексирования: Tue Oct 2 12:22:39 2012 Кодировка: koi8-r

Темы курсовых работ для студентов 1-4 курсов факультета биоинженерии и
биоинформатики МГУ имени М.В.Ломоносова на 2007-2008гг.
Объект исследования: фермент простагландин-Н-синтаза (PGHS,
циклооксигеназа К.Ф.1.14.99.1).
Фермент простагландин-Н-синтаза (PGHS).
Фермент PGHS является составной частью полиферментной системы,
осуществляющей в организмах высших животных синтез простагландинов и
родственных им соединений. PGHS является бифункциональным ферментом и
катализирует 2 реакции - циклооксигеназное окисление арахидоновой кислоты
двумя молекулами кислорода с образованием простагландина G2 и пероксидазное
восстановление перекисной группы простагландина G2 в присутствии донора
электронов с образованием простагландина H2. Установлено, что мишенью
аспирина, является фермент PGHS. За открытие механизма действия аспирина в
1982 году была присуждена Нобелевская премия по физиологии и медицине. С
тех пор интерес к изучению PGHS усилился. Это связано с исключительно
важной ролью, которую играют простагландины и родственные им соединения
тромбоксаны и простациклины в развитии воспалительных процессов, повышения
температуры, аллергических реакций, иммунного ответа, в свертывании крови,
показано их участие в возникновении раковых опухолей и болезни Альцгеймера.
Поэтому регуляция их синтеза - актуальная задача на сегодняшний день.
Тема ?1. Исследование инактивации фермента простагландин-Н-синтазы в
ходе реакции методом масс-спектрометрии.
Обе реакции PGHS сопровождаются быстрой и необратимой инактивацией
фермента в процессе реакции. Химический механизм инактивации PGHS к
настоящему времени не известен. В нашей лаборатории мы предположили
возможные механизмы инактивации фермента PGHS на основе кинетических
данных (по результатам опубликовано 3 статьи), но исследования
инактивации продолжаются, в частности методом масс-спектрометрии.
Требуется 2-3 студента желательно 3-4 курсов. Работа позволит овладеть
основными методами работы с белками: выделение фермента из биологического
материала, очистка методом колоночной хроматографии, измерение его
активности, концентрации, проведение электрофореза. Также вы научитесь
исследовать белковые образцы современным и перспективным методом масс-
спектрометрии и анализировать полученные спектры.
Тема ?2. Расчет взаимодействия основных субстратов (арахидоновой
кислоты, простагландина G2 и Н2, кислорода и др.) с активными центрами
фермента простагландин-Н-синтазы методами квантовой химии и молекулярной
динамики.
В нашей лаборатории созданы молекулярные модели для арахидоновой
кислоты и простагландинов G2 и H2, проведена геометрическая оптимизация
этих структур с помощью квантово-химического пакета программ GAMESS.
Получены значения основных параметров: длин валентных связей, значений
валентных и торсионных углов. Необходимо промоделировать взаимодействие
фермента PGHS с арахидоновой кислотой и простагландинами, и получить, таким
образом, важную информацию о механизме взаимодействия этих соединений. Для
этой работы требуется 2-3 студента 1-4 курсов.

Супервайзер:
Д.х.н., профессор Вржещ Петр Владимирович
Факультет Биоинженерии и Биоинформатики МГУ, к. 447 корпуса "Б
тел. 939-42-18
e-mail: peter@genebee.msu.ru
Тьютор:
к.х.н. Цаплина Людмила Александровна, сотрудник лаборатории Вржеща П.В.
Факультет Биоинженерии и Биоинформатики МГУ, к 614 корпуса "Б"
тел. 938-23-23 (раб), 8-(926)-687-12-61 (моб)
e-mail: tsaplina-ludmila@yandex.ru