Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/StudentScience/themes_2007s/Sergeeva_2.doc Дата изменения: Mon Feb 19 18:06:17 2007 Дата индексирования: Tue Oct 2 12:31:23 2012 Кодировка: koi8-r

Группа под руководством
д.х.н. Сергеевой Марины Глебовны
Отдел биокинетики
Института физико-химической биологии им. А.Н.Белозерского


«Контроль клеточного цикла: реконструкция этапов формирования системы»
(биоинформатика, 3 курс)


Изучение регуляции клеточного цикла - актуальная задача, в связи с
развитием новообразований при нарушениях этой регуляции, и в то же время
фундаментальная, так как деление клетки - базовый процесс, лежащий в основе
живого.
Система, регулирующая пролиферацию клеток, состоит из широкого спектра
негомологичных белков, имеет сложную структуру и комплексно связана с
другими регуляторными клеточными системами в организме.
Алгоритм положительной регуляции клеточного цикла в качестве основных
компонентов включает в себя внеклеточные сигналы (цитокины-факторы роста,
межклеточные взаимодействия, внеклеточный матрикс), систему рецепции
(рецепторные тирозинкиназы, интегрины, Notch) и передачи сигнала из
цитоплазмы в ядро (нерецепторные тирозин-киназы, белки Ras, MAP-киназный
каскад, PI3-киназа, протеинкиназа B, протеинкиназа C, STAT, ?-катенин,
Gli), набор ядерных транскрипционных факторов и интегрирующие регуляторы -
циклины и циклинзависимые киназы.

[pic]

Помимо положительной регуляции продвижения по клеточному циклу ключевую
роль играет негативная регуляция (PTEN-фосфатаза, транскрипционные факторы,
ингибиторы цинлинзависимых киназ CKI семейств Ink4 и Cip/Kip и др.).
В лаборатории была создана и апробирована на примере сигнального каскада
арахидоновой кислоты методика филогенетического скрининга белков человека
(реализована на языке программирования Perl). Методика позволяет в
полуавтоматическом режиме строить филогенетический профиль белков человека
(т.е. определять, в каких организмах с расшифрованными геномами
присутствуют эволюционно и функционально близкие белки), а также
филогенетические деревья соответствующих семейств. Полученная информация
позволяет судить о последовательности появления компонентов и их включения
в функциональную систему в ходе эволюции, а также выделять синхронно
сформировавшиеся модули. Информация полезна для понимания функционирования
современной системы в организме человека.
Предлагается тема для курсовой работы «Контроль клеточного цикла:
реконструкция этапов формирования системы». Провести филогенетический
скрининг по возможности более широкого круга компонентов системы,
проанализировать результаты в контексте знаний о механизмах ее работы у
человека, отдельно обсудить белки с нетипичными эволюционными траекториями.
Сделать выводы об особенностях процесса формирования системы в ходе
эволюции, на основании этого предложить гипотезы, касающиеся структуры и
функционирования системы у человека.

Контакты:
д.х.н. Сергеева Марина Глебовна,
д.х.н. Мевх Алевтина Трофимовна,
комната 606 (корпус «Б»), sergeeva@genebee.msu.su; 939-4332
Пожелания:
сочетание умения работать в команде с желанием самостоятельно работать над
проектом, инициативность. Вся литература на английском языке.