|
|
В папке для зачетных упражнений создайте новую рабочую книгу, H:\Term1\Block2\Credits\Credit2.xls. Внимание! Имена
директорий и имя файла должны в точности соответствовать заданным.
Аминокислотную последовательность для варианта ?1 можно найти в файле Р:\Term1\Credit2\var1.txtс, а для варианта 2 в файле Р:\Term1\Credit2\var2.txt.
- Вариант 1
Скопируйте аминокислотную последовательность в одну ячейку на лист "AAfreq" рабочей книги Credit2.xls.
Превратите последовательность в столбик букв (см. упр.2 занятия 7).
- Задание 1. Определить аминокислотный состав заданного белка.
На листе "AAfreq" создайте еще одну таблицу, в первом столбике которой будут однобуквенные обозначения всех 20 аминокислот (скопируйте этот столбик
из ваших рабочих данных), а во втором столбике количества соответствующих аминокислотных остатков в заданной последовательности, вычисленные
с помощью функции СЧЕТЕСЛИ (COUNTIF).
- Задание 2. Определить средний суммарный электрический заряд молекулы заданного белка.
Скопируйте таблицу с полученным в п.1 аминокислотным составом на лист "Charge" рабочей книги Credit2.xls.
На основе данных этой таблицы определите заряд молекулы белка, см. подсказку ниже.
- Задание 3. Определить молекулярную массу заданного белка.
Скопируйте таблицу с полученным в п.1 аминокислотным составом на лист "MW" рабочей книги Credit2.xls.
Молекулярные массы отдельных аминокислот см. в файле Р:\Term1\Credit2\AA_MW.txt.
Добавьте к таблице третий столбик, в котором для каждой аминокислоты будет указана ее масса.
Ниже напишите формулу для вычисления молекулярной массы белка. Полезно понимать, что белок - это не куча аминокислот...
- Вариант 2
Скопируйте аминокислотную последовательность в одну ячейку на лист "MW" рабочей книги Credit2.xls.
Превратите последовательность в столбик букв (см. упр.2 занятия 7).
- Задание 1. Определить молекулярную массу заданного белка.
Откройте файл с массами отдельных аминокислот (Р:\Term1\Credit2\AA_MW.txt). Поместите таблицу с массами на лист "АА_MW" рабочей книги Credit2.xls
и замените полные названия аминокислот на однобуквенные.
На листе "MW" с помощью функции ВПР (VLOOKUP) в ячейке справа от каждой буквы поставьте массу соответствующей аминокислоты.
(см. подсказку ?3 к заданию 8).
Ниже таблицы напишите формулу для вычисления молекулярной массы всего белка. Полезно понимать, что белок это не куча аминокислот...
- Задание 2. Определить средний суммарный электрический заряд молекулы заданного белка.
Все вычисления представьте на листе "Charge" книги Credit2.xls.
Создайте таблицу, в первом столбике которой напишите однобуквенные обозначения аминокислот, боковые группы которых заряжены при рН=7.0, см. подсказку ниже.
Во втором столбике укажите заряд, а в третьем количество аминокислотных остатков в заданной последовательности, вычисленное с помощью функции СЧЕТЕСЛИ (COUNTIF).
Ниже напишите формулу для вычисления суммарного среднего заряда белка.
- Задание 3. Определить распределение длин белков B. subtilis.
- Создайте лист "prot_length". Перенесите на лист данные из файла P:/y09/Practice9/ Bsub_prot.xls, где для каждого белка этой бактерии
указана длина аминокислотной последовательности, т.е. число аминокислотных остатков. Нужно построить гистограмму, отражающую распределение длин белков.
- Впишите в столбце C диапазоны длин белков, то есть, введите числа от 100 до 2000 с интервалом 100.
- Выберите Меню - Сервис - Анализ данных - Гистограмма (Menu - Tools - Data Analysis - Histogram).
- В качестве Входного интервала (Input Range) укажите все ячейки с длинами белков, в качестве Интервала карманов (Bin Range) - диапазон длин белков.
Выходной интервал (Output Range) должен включать два столбца и на две строки больше, чем интервал карманов.
Обязательно поставьте галочку возле Вывод графика (Chart Output).
- Отформатируйте гистограмму так, чтобы были указаны значения столбцов.
- ПодсказкаПри рН=7.0 боковые группы аргинина и лизина имеют средний заряд, равный +1е, гистидина +0.5е, а
остатков аспарагиновой и глутаминовой кислот имеют средний заряд -1е, остальные аминокислотные остатки при рН=7.0 практически не заряжены.
|