Зачетное задание по блоку 3
Задание состоит в оформлении результатов практикумов
и представлении их на своем веб-сайте. Сроки выполнения:
– для группы 101: вечер 21 декабря;
– для группы 102: вечер 17 декабря.
Вы должны создать следующие веб-страницы
(в нижеследующем списке жирным шрифтом выделено заглавие
(<H1>), которое должна иметь страница;
тот же текст должна иметь гиперссылка с главной страницы первого семестра):
- Состав записи 0XXX банка PDB
.
Здесь должна присутствовать информация о составе записи (
домашнее задание к практикуму 11);
страничка должна быть в формате HTML!
Ниже — краткое описание одной из цепей белка:
изображения цепи в остовной модели (результаты задания 4 практикума 11
и задания 2 практикума 13),
характеристика вторичной структуры
(какого типа белок, сколько в данной цепи альфа-спиралей и бета-тяжей).
- (*)
(необязательный пункт; название придумайте сами) —
описание общей формы белка, оценка
его абсолютных и относительных размеров (задание 4
практикума 12); желательна картинка.
- Контакты название лиганда с белком таким-то
по данным записи 0XXX
— результаты задания 1 практикума 13, то есть список остатков, контактирующих
с лигандом и изображение контактов одного из этих остатков. То и другое должно иметь
надлежащие заголовки.
- Элемент вторичной структуры белка такого-то
—
результаты задания 1 практикума 14 (включая
формулировку правила, описывающего "паттерн" водородных связей между
остовными атомами элемента).
- (*) Контакты альфа-спирали такой-то
(или бета-тяжей таких-то) с остальной структурой
(необязательный пункт)
— результаты задания 4 практикума 13.
- Торсионные углы
.
На этой страничке должны присутствовать (с разумными пояснениями)
полученные вами точечные диаграммы торсионных углов φ и ψ
(задание 2 практикума 14).
Все картинки и таблицы должны иметь заголовки либо подписи!
Каждая страница должна быть "самодостаточна", то есть понятна постороннему человеку
без обращения к тексту заданий.
Гиперссылки со страницы первого семестра должны быть разумно организованы
(правильно будет создать из ссылок на новые страницы ненумерованный
список под общим заголовком "Структура белка такого-то").
Нумеровать страницы не надо:
приведенная нумерация — исключительно для лучшего понимания.
Задания, обозначенные звездочкой (*) — дополнительные
(на зачет не влияют, но влияют на рейтинг).
По вашему сайту будут оцениваться:
А) правильность полученных результатов;
Б) наглядность представления результатов.
Кроме того, по вашим рабочим директориям будут оцениваться:
Г) скрипты, которые вы составляли на практикумах;
Д) порядок в директориях.
Имеет смысл за пару дней до зачета проверить состояние рабочих директорий.
Сроки зачетов
Зачет по третьему блоку будет приниматься:
– у группы 101 22 декабря (понедельник) с 15:35 до 17:20
– у группы 102 19 декабря (пятница) с 9:00 до 10:35
На зачете никаких добавочных заданий не будет, а будут проверяться результаты и оформление обязательных заданий.
Тем, у кого будет обнаружены те или иные недочеты, будет предоставлена возможность их исправить.
Долги по всем блокам будут приниматься у обеих групп 22 декабря с 17:20 до 20:00 и
(только у тех, у кого долгов останется мало) 25 декабря с 10:55 до 13:00.
Те, кто не отчитается по всем обязательным заданиям к 13:00 25 декабря, будут вызваны 29 или 30 декабря
на специальную комиссию и с высокой вероятностью останутся без зачета
(со всеми вытекающими грустными последствиями).