Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/year_07/term4/MolBiol/Minimum.doc Дата изменения: Mon May 25 11:00:59 2009 Дата индексирования: Mon Aug 17 22:18:43 2009 Кодировка: koi8-r

Минимальная программа по молекулярной биологии

Обратите внимание: ВСЕ пункты этой программы должны быть вам известны. Это
категорический минимум!

1. Строение нуклеиновых кислот. Сахарофосфатный остов. 5'- и 3'-концы.
Уотсон-криковские пары. А-, В-, Z-формы. Большая и малая бороздки.
Кольцевые и линейные молеклы ДНК. Сверхспирализация. Топоизомеразы.
Отличия ДНК от РНК.

2. Репликация.
Вилка репликации, направление синтеза, "ведущая" и "отстающая" нити при
репликации. Фрагменты Оказаки. Комплекс белков в репликационной вилке.
Полимеразы I и III, праймаза, хеликаза, лигаза, SSB, топоизомераза.
Точность воспроизведения ДНК, 3'-5'-экзонуклеазная активность.
Репликативные ДНК-полимеразы эукариот. Множественность ориджинов. Репликон.
Проблема репликации линейного незамкнутого фрагмента ДНК. Теломеры и
теломераза, роль ее РНК-компонента.

3. Репарация.
Классификация типов репарации. Прямая репарация тиминовых димеров и
метилированного гуанина. Эксцизионная репарация оснований (BER).
Эксцизионная репарация нуклеотидов (NER). Репарация неспаренных нуклеотидов
(mismatch-репарация). Репарация двухнитевых разрывов (пострепликативная
рекомбинация и объединение негомологичных концов ДНК). Выбор репарируемой
нити ДНК. SOS-ответ у бактерий.

4. Рекомбинация.
Инициация рекомбинации при однонитевых разрывах. Функции комплекса RecBCD.
Функции RecA-белка. Структура Холлидея в модели рекомбинации. Миграция
ветви, гетеродуплексы, "разрешение" структуры Холлидея. Инициация
рекомбинации при двунитевых разрывах ДНК. Мейотическая и соматическая
рекомбинация у эукариот.

5. Транспозоны у про- и эукариот.
ДНК-транспозоны. Репликативная и нерепликативная транспозиция. Транспозаза.
IS- и Tn-элементы бактерий. Ретроэлементы эукариот. Обратная транскриптаза
(ревертаза). Эндогенные ретровирусы, LINE- и SINE-элементы.

6. Транскрипция у прокариот.
Стадии транскрипционного цикла. Инициация, элонгация и терминация. РНК-
полимеразы прокариот: кор-фермент и сигма-факторы. Основной и
альтернативный сигма-факторы. Промотор генов прокариот, его структурные
элементы: -10 и -35. Опероны, полицистронные матрицы. Сопряжение
транскрипции с трансляцией. Активаторы и репрессоры. Роль низкомолекулярных
лигандов в регуляции. Лактозный оперон. CAP-белок (CRP). Репрессор
лактозного оперона. Кооперативность: роль димеризации в регуляции. Петли
отрицательной положительной обратной связи.

7. Транскрипция у эукариот.
РНК-полимеразы эукариот I, II и III и транскрибируемые ими гены.
Базальная транскрипция. Структура промотора генов, транскрибируемых
полимеразой II. Факторы базальной транскрипции. ТBP и TAF факторы.
Регуляция транскрипции генов, транскрибируемых полимеразой II. Регуляторные
областиевоворыпар промоторов полимеразы II у эукариот. Энхансеры,
инсуляторы и сайленсеры. Петлевая модель. Комбинаторный принцип в регуляции
транскрипции. Метилирование ДНК. CpG-островки. Роль метилирования ДНК в
регуляции транскрипции. Эпигенетическое наследование.

8. Хроматин.
Компактизация ДНК. Нуклеосома, линкерная ДНК. Гистоны, входящие в состав
нуклеосомы, и гистон Н1. Ацетилирование и метилирование гистонов, его
влияние на транскрипцию ("гистоновый код").

9. Процессинг РНК.
Кэпирование, сплайсинг и полиаденилирование транскриптов, синтезируемых
полимеразой II. Роль малых ядерных РНП. Химическая основа сплайсинга -
нуклеофильные атаки 2' и 3'гидроксильных групп. Альтернативный сплайсинг.

10. Трансляция. Инициация трансляции у про- и эукариот. Последовательность
Шайн-Дальгарно. Роль кэпа и поли-А-последовательности в инициации. IRES'ы.
Элонгационный цикл. Связывание аминоацил-тРНК. Пептидилтрансферазная
реакция. Транслокация. Белковые факторы, катализирующие связывание аа-тРНК
и транслокацию. Стоп-кодоны.