|
|
Cеместр III. Последовательности и структуры нуклеиновых кислот
|
|
Студенты учатся работать с банками нуклеотидных последовательностей,
знакомятся с пространственными структурами нуклеиновых кислот, учатся сравнивать
нуклеотидные последовательности, а также получают первое представление
о методах поиска кодирующих участков и слабых сигналов в последовательностях НК.
|
|
Блок 1: структуры нуклеиновых кислот
|
|
|
1.
|
Нуклеиновые кислоты, строение и структура (лекция)
|
|
1, 2 сентября, А.Б.Рахманинова, А.В.Головин
|
|
[презентация]
[упражнения]
[материалы к упражнениям]
[задания к отчету]
[дополнительная литература]
|
|
|
2.
|
Разбор заданий.
Тест "Химическое строение нуклеиновых кислот"
|
|
8,9 сентября, А.Б.Рахманинова, А.В.Головин, О.Занегина
|
|
[вопросы теста]
|
|
|
3.
|
Обсуждение заданий. Тест "Структура нуклеиновых кислот"
|
|
15, 16 сентября, А.Б.Рахманинова, А.В.Головин, О.Занегина
|
|
[вопросы теста]
|
|
|
4.
|
Итоговая контрольная работа.
Обсуждение проблем при подготовке отчета.
|
|
22, 23 сентября, А.Б.Рахманинова, А.В.Головин, О.Занегина
|
|
[задания контрольной]
|
|
|
5.
|
ДНК-связывающие белки (лекция). Обсуждение результатов.
|
|
29, 30 сентября, А.Б.Рахманинова, А.В.Головин, О.Занегина
|
|
|
Правила
получения зачета за первый блок.
|
|
|
Блок 2: нуклеотидные последовательности
|
|
|
6.
|
Интерпретатор командной строки bash
|
|
6,7 октября, С.А.Спирин
|
|
[упражнения]
|
|
|
7.
|
Банк EMBL
|
|
13,14 октября, С.А.Спирин
|
|
[упражнения]
[презентация]
|
|
|
8.
|
Программы пакета BLAST (лекция)
|
|
21,27 октября, С.А.Спирин
|
|
[упражнения]
[материалы]
|
|
|
9.
|
Пакет BLAST (продолжение)
|
|
28 октября, 3 ноября, С.А.Спирин
|
|
[упражнения]
|
|
|
10. |
Зачетная работа по BLAST (аннотирование участка генома) |
|
10,11 ноября, С.А.Спирин |
|
[задание]
|
|
|
Блок 3: поиск сигналов |
|
|
|
12. |
Лекция |
|
17,18 ноября, Д.Равчеев |
|
[задания]
|
|
со всеми вопросами можно обращаться непосредственно к Дмитрию Андреевичу Равчееву
|
|
13. |
Разбор заданий (семинар) |
|
24,25 ноября, Д.Равчеев |
|
|
Блок 4: предсказание генов |
|
|
|
14. |
Лекция |
|
1,2 декабря, Е.Ермакова |
|
[задания]
|
|
со всеми вопросами можно обращаться непосредственно к Екатерине Олеговне Ермакововй
|
|
15. |
Разбор заданий (семинар) |
|
8,9 декабря, Е.Ермакова
|
|
16. |
Обсуждение результатов 3-его и 4-го блока (семинар) |
|
15,16 декабря |
|
|
|
|
Зачет (для обеих групп):
23 декабря (вторник) с 15:30 до 19:00;
24 декабря (среда) с 15:00 до 17:10. |
|
Задание
контрольной по bash
|