Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2007
| Cеместры | Студенты | Преподаватели |
| На главную страницу | ||
|
2006 | |
|
2005 | |
|
2004 | |
|
2003 | |
 |
|
2002 |
Cеместр II. Последовательности белков |
|||
| Студенты продолжают изучение своих белков. На примере их последовательностей студенты учатся работать с наиболее употребительными базами данных и программами. | |||
|
Белки, выданные студентам |
|||
Блок 1: Базы данных |
|||
1. |
Банк SwissProt |
||
| 8 февраля, С.А.Спирин, А.В.Головин | |||
| [презентация] [задания] [материалы] | |||
2. |
Поисковая система SRS |
||
| 15 февраля, С.А.Спирин, А.В.Головин | |||
| [задания] [указания] | |||
3. |
Банк MedLine (PubMed) |
||
| 22 февраля, А.В.Головин, С.А.Спирин | |||
| [задания] [доп. задания] | |||
Блок 2: выравнивания |
|||
4. |
Парное выравнивание белковых последовательностей |
||
| 29 февраля, С.А.Спирин | |||
| [задания] [доп. задания] | |||
5. |
Парное выравнивание (продолжение). Работа в командной строке Linux |
||
| 7 марта, С.А.Спирин | |||
| [задания] [материалы] [презентация] | |||
6. |
Программа BLASTP |
||
| 14 марта, С.А.Спирин, Д.Н.Жемолдинов | |||
| [задания] | |||
7. |
Контрольная по BLAST |
||
| 21 марта | |||
| [задание на контрольную] | |||
8. |
Биологический смысл выравнивания последовательностей белков |
||
| 28 марта, А.В.Алексеевский, С.А.Спирин | |||
| [зачетное задание] [помощь по программе GeneDoc] [исходные данные] [презентация] | |||
Блок 3: семейства белков |
|||
9. |
Множественное выравнивание |
||
| 4 апреля, А.Б.Рахманинова | |||
| [задания] [подсказки] [презентация] | |||
10. |
Паттерны и профили |
||
| 11 апреля, А.Б.Рахманинова | |||
| [задания] [подсказки] [презентация] | |||
11. |
PSI-BLAST |
||
| 18 апреля, С.А.Спирин | |||
| [задания] | |||
12. |
Pfam и InterPro |
||
| 25 апреля, А.Б.Рахманинова | |||
| [задания] | |||
Объявления |
1. Следующее занятие состоится 4 мая в 15.35 Тема – подготовка к итоговой контрольной, переписывание контрольной второго блока, работа над ошибками...[типичные задачки для самоподготовки] 2. Отчет по заданиям 3-его блока следует сдать до 1-го мая. Формат – HTML-странички, прикрепленные к учебному сайту. |
||