Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2007
| Cеместры | Студенты | Преподаватели |
| На главную страницу | ||
|
2006 | |
|
2005 | |
|
2004 | |
|
2003 | |
 |
|
2002 |
|
Cеместр IV. Последовательности: эволюция и функция |
||
|
Круг задач расширяется:
от изучения отдельных последовательностей и структур переходим к изучению
подходов и ресурсов, предназначенных для филогенетической реконструкции,
функциональной аннотации, к изучению конкретного белкового семейства.
|
||
|
Блок 1: эволюция последовательностей или введение в молекулярную филогенетику |
||
|
1. |
Молекулярная эволюция, построение модели (лекция+практикум) |
|
| 10 февраля, Е.А.Аксянов, А.В.Алексеевский | ||
|
[презентация] [упражнения] [материалы к упражнениям] [задания к отчету] [дополнительная литература] |
||
|
2. |
Эволюционная модель и эволюционные расстояния (лекция+семинар+тест) |
|
| 17 февраля, Е.А.Аксянов, А.В.Алексеевский | ||
| [вопросы теста] | ||
|
3. |
Алгоритмы построения филогенетических деревьев (лекция+тест) |
|
| 24 февраля, Е.А.Аксянов, А.В.Алексеевский | ||
| [вопросы теста] | ||
|
Блок 2: функции или проблемы функциональной аннотации |
||
|
6. |
Функции. Онтологии базы данных GO. |
|
| 24 марта, Д.А.Равчеев, С.А.Спирин | ||
| [презентация] [задания] [дополнительные задания] [варианты] | ||
|
7. |
Функции. Классификация. Коды ферментов. |
|
| 31 марта, Д.А.Равчеев, С.А.Спирин | ||
| [презентация] [задания] [дополнительные задания] [варианты] | ||
|
8. |
Метаболические пути. KEGG. |
|
| 7 апреля, Д.А.Равчеев, С.А.Спирин | ||
| [презентация] [статья о KEGG] [задания] [варианты] | ||
|
9. |
Предсказание трансмембранных белков. |
|
| 14 апреля, Д.А.Равчеев, С.А.Спирин | ||
| [презентация] [задания] [варианты] [подсказки] | ||
| [правила получения зачета за 2 блок] | ||
| [результаты по состоянию на 29 мая 2009 (в xls)] | ||
|
Блок 3: эволюция семейства белков |
||
|
10. |
Эволюционные домены белков. |
|
| 22 апреля, А.В.Головин, А.Б.Рахманинова | ||
| [презентация] [задания] [подсказки] | ||
|
11. |
Продолжение работы над проектом.... |
|
| 5 мая, А.В.Головин, А.Б.Рахманинова | ||
|
12. |
Завершение работы над проектом |
|
| 12 мая, А.В.Головин, А.Б.Рахманинова | ||
|
Правила получения зачета за третий блок
|
||