Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.su/FBB/year_02/science_1/otzyvy/onIvanova.doc Дата изменения: Fri Nov 14 18:05:52 2003 Дата индексирования: Tue Oct 2 00:42:05 2012 Кодировка: koi8-r

Рецензия на работу "Эволюция пространственных структур гомеодоменов"
студентки 2-го курса факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ Ивановой
Дарьи

Работа Дарьи Ивановой посвящена сравнительному анализу пространственных
структур белковых доменов, относящихся к семейству гомеодоменов. В
настоящее время существуют расшифровки структур достаточно большого
количества различных гомеодоменов.

Задачей студентки было сравнить структуры гомеодоменов, используя созданную
в нашей группе программу "Life Core". Эта программа предназначена для
иерархической классификации заданного семейства структур, основанной на
выявлении геометрических ядер подсемейств, состоящих из двух или более
представителей. Под геометрическим ядром понимается набор атомов, одинаково
расположенных во всех структурах подсемейства.

Программа "Life Core" новая, нам не известны ее прямые аналоги. Поэтому
исходно результат трудно было предсказать.

Дарья Иванова успешно справилась с поставленной задачей и получила
интересные результаты. Выяснилось, в частности, что информации о количестве
одинаково расположенных С?-атомов у каждой пары структур гомеодоменов
достаточно для адекватной реконструкции разбиения гомеодоменов на
подсемейства. Этот результат свидетельствует в пользу применимости подхода,
положенного в основу программы "Life Core", к классификации
пространственных структур белков. В настоящее время нами готовится
публикация, включающая, в частности, описание результатов, полученных при
непосредственном участии Д. Ивановой.

Текст работы содержит отдельные мелкие неточности (в частности, программа
"Life Core" названа Web-сервисом, в то время как в настоящее время она не
является постоянно работающим Web-сервисом, хотя и снабжена Web-
интерфейсом). При этом общее впечатление от работы Д. Ивановой весьма
благоприятное; на будущее хотелось бы только пожелать ей несколько большей
инициативности и самостоятельности.

Мы считаем, что работа Дарьи Ивановой заслуживает отличной оценки.


С.А. Спирин

А.В. Алексеевский