Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.su/FBB/year_04/doc/help5.doc Дата изменения: Tue Oct 12 21:53:00 2004 Дата индексирования: Mon Oct 1 21:30:10 2012 Кодировка: koi8-r

Ключевые слова:
Векторная и растровая графика. Химическая структура. D и L формы
аминокислот.
Пространственная структура. Структуры и реакции. ACD ChemSketch.

Подсказки к ChemSketch.

1. а) Первый рис.

- Убедитесь, что установлен режим Structure (а не Draw) - см. во
второй строчке верхнего меню, слева.

- Для рисования структурной формулы выберите инструмент Draw normal
(5я слева кнопка в третей строчке верхнего меню)

- Атомы выбираются из левого меню (и вставляются щелчком мыши), связи
протягиваются при удерживании левой кнопки мыши

- Что бы превратить одинарную связь в двойную, щелкните по этой
связи; следующие щелчки вернут ее в одинарную

- Для установления заряда служит инструмент Increment Charge -
предпоследняя кнопка снизу в левом меню. Переключение "+" на "-" и
наоборот выполняется в подменю, вызываемом щелчком по белому уголку

Второй и третий рис.

- Скопируйте первый рис. Для этого выберите инструмент Select/Move
(крайняя левая кнопка в третей строке верхнего меню), обведите рис.
прямоугольником, далее - обычные +C, +V.

- Выделенные части рисунка, например, атомы, можно передвигать.
Используйте это при создании 2го и 3го рис.

- Замена связи на символы "связь выходит над плоскостью рисунка" и
"связь уходит под плоскость рисунка" - с помощью соответствующих
инструментов из верхнего меню, третья строка.

Подписи

- Для внесения подписей выберите режим Draw (а не Structure). В левом
меню, третья кнопка снизу, найдете инструмент, позволяющий создать
окно для текста.

- Для внесения самого текста выберите инструмент Edit text - 4я
кнопка слева в третей строке верхнего меню.

б) ----

в) Новое окно создается в меню Pages. Проведите трехмерную
оптимизацию, отыскав в меню необходимый инструмент. Перейдите в 3D
Viewer (из меню ACD/Labs).
2. - Для изображения реакции используются знаки "+" и "=>" (найдите
соответствующие инструменты в меню и поставьте нужные знаки в рабочее
поле).

- Скопируйте необходимые аминокислоты в левую и правую части
уравнения (можно использовать меню Template).

- Для объединения двух аминокислот в дипептид достаточно перетянуть
мышкой атом азота одной на атом кислорода другой.

- Для приведения длин связей и углов к принятому виду можно выделить
дипептид и применить инструмент Clean Structure.


3. - Скопируйте дипептид из задания 2 и соедините с третей аминокислотой,
получив трипептид. Возможно, возникнут дизайнерские проблемы -
инструмент Clean Structure плохо справляется с трипептидами!

- Вручную, перетаскивая атомы, приведите структуру дипептида к
традиционному виду - атомы N-C( -C- N-C( -C-N-C( -C идут зиг-загом
(после этого, возможно, и Clean Structure сработает!)

- Для покраски выделите связи (инструмент Select/Move) в остове
пептида. Два варианта: либо удастся окружить их прямоугольником или
лассо; либо удерживая Shift, выделяйте их все по одной

- Двойной щелчек по выделенному приводит к появлению окна Properties,
в котором можно задать а) толщину линий (скажем, 3pt вместо 0.7pt) и
их цвет.


====== Еще раз об инструментах ChemSketch ====================


- Операции по перемещению, оптимизации и т.д. можно производить и с частью
фигуры, предварительно её выбрав. Для выделения части формулы выберите
инструмент Select/Move.
- Что бы «превратить» одинарную связь в двойную, выберите инструмент "Draw
normal" и просто щелкните по выбранной связи, так же можно изменить вид
связи с помощью инструментов «Up stereo bond» и «Down stereo bond».
- Для изменения типа атома (например C на N) просто выберите новый тип из
панели слева и щелкните по объекту изменения. Внимательно изучив панель
справа, таким же образом можно изменить заряд и прочие свойства атома.
- Если вся ваша структура или её часть выглядят «криво», то используйте
кнопку "Clean structure" для того что бы привести углы и длинны связей к
стандартным значениям.
- Активно пользуйтесь заготовками, список заготовок можно вызвать, нажав
клавишу F5.
- Для изменения внешнего вида ковалентных связей в программе Chemsketch
сначала надо выделить связи. Для этого удобно использовать инструмент
Select/Move при этом удерживая клавишу SHIFT. После того как выделение
закончено, щёлкните 2 раза по одной из выделенных ковалентных связей. В
появившимся окне сделайте необходимые изменения (Atom style, Bond style)
и примените их (Apply).
- Что бы сделать подписи перейдите в режим DRAW, выберите инструмент TEXT
(справа), для редактирования текста нажмите на белый уголок и выберите T
- Для создания новой страницы выберите пункт меню Pages-New.
- Для перехода в 3D режим выберите пункт меню ACD/Labs - 3D Viewer.