Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~seferyan_m/projects/pmol_3/map.html
Дата изменения: Mon Dec 20 10:35:40 2010
Дата индексирования: Tue Oct 2 19:09:01 2012
Кодировка: Windows-1251

Электронная плотность

Московский Государственный Университет имени М.В.Ломоносова Факультет Биоинженерии и Биоинформатики Учебный сайт Сеферяна Мелика

I Семестр

II Семестр

Полезные ссылки

Электронная плотность.

1. Карта электронной плотности для записи 2B5A.pdb находится в файле 2b5a.omap.
Для глутамина 21 цепи C, имеющего две альтернативные конформации было построено изображение в PyMOL:

Желтым обозначена поверхность уровня 1, белым - 0.5.

Глутамин 21 цепи A не имеет альтернативных конформаций:

Желтым обозначена поверхность уровня 1, белым - 0.5.

2. К сожалению, для записи 1PKV электронная карта была недоступна на сайте http://eds.bmc.uu.se/eds/.
Поэтому изображение большого аминокислотного остатка с электронной плостностью было построено для 39-го тирозина цепи А из записи 2B5A:

Желтым обозначена поверхность уровня 1, белым - 0.5.