Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~sench/mlta_ecoli/2ae0.html
Дата изменения: Mon Dec 29 18:17:48 2008
Дата индексирования: Tue Oct 2 10:11:14 2012
Кодировка: Windows-1251

Состав записи 2ae0 банка PDB

Список страниц студентов 1-го курса
Официальный сайт Факультета биоинженерии и биоинформатики

Состав записи 2ae0 банка PDB

HEADER	HYDROLASE 21-JUL-05 2AE0 Поле 'Header' содержит название типа структуры, в данном случае - гидролаза, а также дату создания файла о структуре и ее идентификатор в банке PDB
TITLE	CRYSTAL STRUCTURE OF MLTA FROM ESCHERICHIA COLI REVEALS A UNIQUE LYTIC TRANSGLYCOSYLASE FOLD Поле 'Title' содержит некую краткую информацию о структуре. В данном случае, содержание (предположительно) переводится примерно так: кристаллическая структура белка mlta из бактерии Escherichia coli показывает уникальную свертку литической трансгликозилазы.
COMPND	MOL_ID: 1 MOLECULE: MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE A CHAIN: X SYNONYM: MLTA, MUREIN HYDROLASE A, MLT38 EC: 3.2.1.- ENGINEERED:YES Поле 'Compnd' содержит описание структуры молекулы: полное название (связанная с мембраной муреиновая литическая трансгликозилаза А), альтернативные и сокращенные названия, идентификатор и номер цепочек аминокислотных остатков, была ли данная молекула получена в результате генно-инженерного эксперимента или взята из естественной среды
SEQRES	Поле 'Seqres' перечисляет все аминокислотные остатки в трехбуквенном виде, при этом указано к какой цепи они относятся и сколько их в этой цепи. Интересным фактом является то, что в .pdb файле перечислено всего 345 остатков, в то время как в .fasta файле их указано 364.
HET HETNAM FORMUL	В полях "het", "hetnam" и "formul" указана информация о низкомолекулярных веществах, присутсвующих в белке: трехбуквенное название, полное название, альтернативное название если таковое имеется, эмпирическая формула и количество единиц вещества в белке. В случае наличия в белке более одной цепи остатков, также указывается, к какой цепи принадлежат данные вещества

Остовная модель белка

На изображение альфа-спирали отмечены красным, а бета-тяжи - зеленым. В белке присутствуют 14 альфа-спиралей и 13 пар бета-тяжей, поэтому ее нельзя четко отнести ни к альфа, ни к бета-структурным.

На страницу белка
На главную страницу