Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~roman/Term2/Task12.html
Дата изменения: Mon May 29 01:42:04 2006
Дата индексирования: Tue Oct 2 07:25:33 2012
Кодировка: Windows-1251
Pfam Второй семестр

Доменная структура белка GroEL

Изображение доменной структуры одной из цепей белка. (По данным банка Pfam (P0A6F5). Идентификатор записи в банке PDB:1kp8)



Слева изображена полная доменная структура по данным Pfam. Справа— трехмерная структура домена Cpn60_TCP1.

Описание доменной структуры с идентификаторами записи Pfam.



Идентификатор Pfam
Название записи
Полное название домена
Положение в последовательности хххх_Ecoli
PF00118
cpn60_TCP1
Домен cpn60_TCP1
34-519

Подробное описание домена PF00118

  1. Домен Сpn60 восстанавливает поврежденные белковые молекулы. Связываясь с ними, он "считывает" структурную информацию с неповрежденных белковых молекул и переводит поврежденные молекулы в нормальную конформацию.
  2. Данный домен встречается в 4547 последовательностях.
  3. Распределение белков с доменом PF00118 по таксонам.
    Таксон
    Количество белков с доменом PF00118
    Эукариоты Растения 125
    Грибы 251
    Животные 570
    Бактерии 3406
    Археи 96
    Из-за новой систематики количество белков в таблице не совпадает с общим количеством. Для интересующихся систематику можно посмотреть здесь.
  4. После рассмотрения основных типов доменной архитектуры можно сказать, что домен Cpn60 чаще всего один в белке, случаи дупликации неизвестны, случаи перестановки 2-х доменов местами, один из которых Cpn60 отсутствуют.

    ©Роман Зуев