Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~plazmoliz/Term2/uniprot.html
Дата изменения: Fri Feb 29 00:35:07 2008
Дата индексирования: Tue Oct 2 11:48:11 2012
Кодировка: Windows-1251
Банк UniProt

Банк UniProt

  Метка поля Содержание
Код(ы) доступа ("Accession number")  AC  P0A7E1; P05021;
Идентификатор записи в БД  ID   PYRD_ECOLI
Название (краткое описание) белка  DE   Dihydroorotate dehydrogenase

(EC 1.3.3.1)

(Dihydroorotate oxidase)

(DHOdehase)

(DHODase)

(DHOD).
Дата создания документа  DT  13-AUG-1987
Дата последнего исправления аннотации  DT  13-AUG-1987, sequence version 1. 05-FEB-2008, entry version 34.
Число публикаций, использованных при создании документа  RN  5
Журнал и год самой поздней публикации  RL   Mol. Syst. Biol. 2:E1-E5(2006).
Ключевые слова  KW  3D-structure; Complete proteome; Direct protein sequencing;

Flavoprotein; FMN; Membrane; Oxidoreductase; Pyrimidine biosynthesis.
Что содержит поле комментариев?  CC CATALYTIC ACTIVITY COFACTOR PATHWAY SUBUNIT SUBCELLULAR LOCATION SIMILARITY
Идентификаторы записей PDB  DR  1F76

 

  • Пользуясь поисковой машиной сайта Expasy, определим, сколько записей в UniProt описывает белки примерно с тем же описанием (DE), что и белок PYRD_Ecoli. Pезультаты приведены в виде таблицы:

     Запрос  Число записей
    в SwissProt    		 Число записей
    в TrEMBL
     Dihydroorotate 326 691
     EC 1.3.3.1 278 491
      Dihydroorotate oxidase 271 3
     (DHOdehase) 326 691
     (DHODase) 326 691
     (DHOD). 326 691

    Cравнения близких по описанию белков

      Метка поля Белок 1 Белок 2
    Первый код доступа  AC   P0A7E1; P05021;  Q7Z895
    Идентификатор последовательности в БД  ID  PYRD_ECOLI  PYD1_KLULA
    Название (краткое описание) белка  DE  Dihydroorotate dehydrogenase

    (EC 1.3.3.1)

    (DHOdehase)

    (DHODase)

    (DHOD).

    		  Dihydroorotate dehydrogenase (EC 1.3.3.1) (Dihydroorotate oxidase) (DHOdehase) (DHODase) (DHOD).
    Дата создания документа  DT  13-AUG-1987,  01-OCT-2003
    Дата последнего исправления аннотации  DT  05-FEB-2008  15-JAN-2008
    Название организма  OS  Escherichia coli (strain K12)   Kluyveromyces lactis (Yeast) (Candida sphaerica).
    Классификация организма (список таксонов)  OC   Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia.   Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Saccharomycotina; Saccharomycetes; Saccharomycetales; Saccharomycetaceae; Kluyveromyces.
    Длина последовательности  ID   336 AA.   315 AA.
    Молекулярная масса белка  SQ  36775 MW  34989 MW
    Число публикаций, использованных при создании документа  RN  5  2
    Журнал и год самой поздней публикации  RL  Mol. Syst. Biol. 2:E1-E5(2006)   Nature 430:35-44(2004).
    Описание вторичной структуры  FT  С какой по счету и до какой аминокмслоты находятся альфа-спирали либо тяжи,повороты  Белок состоит из 1 цепи,содержащей 315 аминокислот
    Ключевые слова  KW   3D-structure; Complete proteome; Direct protein sequencing; Flavoprotein; FMN; Membrane; Oxidoreductase; Pyrimidine biosynthesis.   Complete proteome; Cytoplasm; FAD; Flavoprotein; Oxidoreductase; KW Pyrimidine biosynthesis.
    Темы, освещенные в комментариях  CC  CATALYTIC ACTIVITY(каталитическая активность)

    COFACTOR (кофактор) PATHWAY(путь выработки) SUBCELLULAR LOCATION(место локализации в клетке)

    SUBUNIT(строение субединиц)

    SIMILARITY(аналогия,сходство)

    		  CATALYTIC ACTIVITY(каталитическая активность)

    COFACTOR (кофактор)

    PATHWAY(путь выработки)

    SUBCELLULAR LOCATION(место локализации в клетке)

    MISCELLANEOUS(разные формы)

    SIMILARITY(аналогия,сходство)
    Особенности последовательности
    		  FT  Длина последовательности и масса белка.  Длина последовательности и масса белка.
    Идентификаторы записей PDB  DR   1F76  

    Сравнения последовательностей

    Второй семестр Первый семестр Главная страница

    ©Петрова Светлана,2007