Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~plazmoliz/Term2/srs.html
Дата изменения: Fri Feb 29 00:36:37 2008
Дата индексирования: Tue Oct 2 08:08:32 2012
Кодировка: Windows-1251
Поисковые системы

Поисковые системы

Результаты упражнений

Сравнение поисковых систем

Все базы данных содержат одинаковую по сути информацию,наблюдаются незначительные хасхождения в обозначении подпунктов ее содержащих.

1.Entry(general) inforation.

В банке МRS указана более ранняя дата последней модификации(13 нояб 2007), нежели чем в SwissPort и SRS(5 фев 2008). Кроме того в SRS содержаться пункты UniRef100 ,UniParc

2.Name and origin of the protein.

В MRS присутствует пукнт Keywords.

3. References

Указания во всех трех базах на 5 одних и техже статей. В SwissPort в отличии отSRS и MRS, не содержиться ссылок на MEDLINE.

4.Comments и Copyriting

Расхождений не наблюдается.

5.Cовпадают пункты в SRS MRS

(в т.ч и в порядке следования), SwissProt

они дополнительно резделены по смысловым группам.

6.Далее в SRS следуют пункты Protein Existence и Keywords.

7. Features

Во всех системах представлена информация,о том с какой по какую аминокислоту находиться спираль или тяж. В SRS и SwissPort также указана длина этого участка.

В MRS есть функия "посветки",т.е в находящейся ниже последовательности, можно посмотреть какие именно аминокистоты входят в состав сприрали или тяжа.

В SRS представленна картинка распределения спиралей,тяжей и поворотов, на которойкаждый из этих элементов находятся на разных уровнях и выделены различными цветами.

2. C gam начинаются следующие таксоны:

gambusia

gammaherpesvirinae

gammapapillomavirus

gammaproteobacteria -английский эквивалент таксона "гамма-протеобактерии" (количество найденных записей=69659)

gammaretrovirus

gammaridea

3.Поиск в SRS

Формулировка функции белка Строка запроса Количество найденных документов
 
Dihydroorotate dehydrogenase 		 
([swissprot-Taxonomy:gammaproteobacteria*] & (([swissprot-Description:Dihydroorotate*] & [swissprot-Description:dehydrogenase*]) | [swissprot-Description:Dihydroorotate dehydrogenase*])) 		 
99
 
Dihydroorotate dehydrogenase (EC 1.3.3.1) (DHOdehase) (DHODase) 		 
((([swissprot-Taxonomy:gammaproteobacteria*] & (([swissprot-Description:Dihydroorotate*] & [swissprot-Description:dehydrogenase*]) | [swissprot-Description:Dihydroorotate dehydrogenase*])) & [swissprot-Description:DHOdehase*]) & [swissprot-Description:DHODase*]) 		 
99
4.Последовательности в Fasta формате.

Второй семестр

Первый семестр

Главная страница

©Петрова Светлана,2007