Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~popkov-v/term7/3-4/3.html
Дата изменения: Tue Dec 25 13:05:55 2012
Дата индексирования: Sun Feb 3 04:16:05 2013
Кодировка: Windows-1251
Седьмой семестр


На главную
К седьмому семестру




Табличка с характеристиками находок BLAST



Белок представлен димером (в связанном с медью состоянии). Длина цепей 69 и 68 а.о.;

 Структура в 2009, Biochemistry.;

 Авторы данной структуры: Stephen Hearnshaw, Claire West, Chloe Singleton, Liang Zhou, Margaret A. Kihlken, Richard W. Strange, Nick E. Le Brun and Andrew M. Hemmings;

 Метод решения фазовой проблемы: SAD. С учетом того, что белок является медь-связывающим, и в его структуре в норме присутствуют 4 связанных (а не свободных, что важно) иона меди, то выбор метода крайне логичен;

 Число измеренных рефлексов: 114794;

 Разрешение: 1.5 A, 18.92 - минимальное и 1.50 - максимальное разрешение для использованных рефлексов;

 Элементарная ячейка
alpha=90.00, beta=101.55, gamma=90.00

 Полнота данных: 94.1%

 значения R-фактора и свободного R-фактора и свои выводы:
В статье: R-фактор (R) = 0,132; R-free фактор = 0,175. R-фактор показывает насколько хорошо расчетная модель подходит экспериментальным данным. Поскольку полностью случайный набор атомов дает значение R-фактора = 0,63, идеальное соответствие - 0, а средние значения около 0,20, то данная структура является достаточно хорошей.
R-free - R-фактор = 0,43 что ниже порогового значения в 0,5 для хорошей модели
     

Выравнивание