Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~popkov-v/term2/last%20report/last.html
Дата изменения: Wed May 26 17:27:01 2010
Дата индексирования: Sat Jun 26 00:42:25 2010
Кодировка: Windows-1251
Последний отчет


На главную
К второму семестру



MEME

Програма Meme нашла 3 мотива, но значение имеет только 1 из них (первый был найден во всех,а второй и третий не были найдены в моем белке).
Координаты 5-47.
P-value 4.67e-37
Относительная энтропия 120 битов
msf файл (muscle "оторвал" одну букву от мотива)


MAST



mastout
Первый мотив был найден в 52 белках bp 68. Третий только в одном. Второй - нигде.
Выравнивания соответствуют друг другу.
MAST не умеет работать с гэпами: присвоил высокий P-value и не отобразил последовательности, которые Pfam выровнял с гэпами.