Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес
оригинального документа
: http://kodomo.cmm.msu.ru/~popkov-v/term2/18.04.10/align.html
Дата изменения: Sun Apr 18 12:13:05 2010
Дата индексирования: Tue Oct 2 18:51:24 2012
Кодировка: Windows-1251
Выравнивание гомологов моего белка
Мой белок крайне мал (69 а.о.), поэтому в нем фактически отсутствуют "лишние части", а это приводит к тому,
что активный центр его гомологов фактически совпадает со всем моим белком. Таким
образом почти все найденные бластом гомологи совпадали на 80-90%. Все найденные белки отвечают за транспорт
металлов и, судя по выравниванию, принципиальную роль здесь играют аминокислоты примерно с
138 по 197 выравнивания (с 6 по 65 в моем белке). Так же выравнивание дало два бессмысленных с
биологической точки зрения участка, выровняв 1-5 и 66-69 а.о. моего белка с какими-то кусками его гомологов,
что, в принципе, логично - концы белков обычно не играют большой роли в выполнении функций.