Состав записи о белке в банке PDB
|
Название поля
|
Тип информации, содержащейся в данном поле
|
Пример (из записи 1duv)
|
Перевод, комментарии
|
HEADER
|
Тип ферментов, к которому относится данный белок (краткое название), дата публикации в банке PDB и идентификационный код
|
TRANSFERASE 18-JAN-00 1DUV
|
Тип белка - трансфераза Опубликован 18 января 2000 г.
|
TITLE
|
Информация о том, что, собственно, представлено в файле (указание на структуру белка, название организма, которому он принадлежит, полное химическое название)
|
CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI ORNITHINE TRANSCARBAMOYLASE COMPLEXED WITH NDELTA-L-ORNITHINE-DIAMINOSPHINYL-N-SULPHONIC ACID
|
Кристаллическая структура белка бактерии Е. coli орнитинтранскарбамойлазы, связанного с N-дельта-L-диаминосфинил-N-сульфониловой кислотой
|
COMPND
|
Информация о количестве полипептидных цепей в составе белка Название молекулы Cиноним названия
|
3 CHAIN: G, H, I
ORNITHINE TRANSCARBAMOYLASE OCTASE-1
|
3 цепи: G, H, I
орнитинтранскарбамойлаза октаза-1
|
SEQRES
|
Последовательность аминокислотных остатков в каждой полипептидной цепи
|
В каждой цепи содержится 333 остатка, цепи идентичны друг другу (гомополимер)
|
—
|
HET
|
Приведены лиганды, связанные с белком, в виде трехбуквенных кодов
|
Лиганды PSQ (связаны с каждой полипептидной цепью) и лиганд MPD
|
—
|
HETNAM
|
Расшифровываются трехбуквенные коды лигандов
|
PSQ - NDELTA-(N'SULPHODIAMINOPHOSPHINYL)-L-ORNITHINE MPD - (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
|
PSQ - N-дельта-(N'сульфодаминофосфинил)-L-орнитин MPD - (4S)-2-метил-2,4-пентадиол
|
FORMUL
|
Брутто-формулы лигандов (также приведены молекулы воды)
|
PSQ - 3(C5 H15 N4 O6 P S) MPD - C6 H14 O2 HOH - *735(H2 O)
|
Перед скобкой дано число молекул лигандов/воды, связанных с белком: PSQ - 3 молекулы, MPD - 1 молекула, вода - 735 молекул.
|